configure.ac

   1 AC_INIT(SAMTOOLS, 0.1.3-17)
   2 AM_CONFIG_HEADER(config.h)
   3 AM_INIT_AUTOMAKE([no-dependencies])
   4 AC_CANONICAL_HOST
   5
   6 AC_PROG_INSTALL
   7
   8 AC_PROG_CC
   9
  10 # set CFLAGS and CXXFLAGS
  11 user_CFLAGS="${CFLAGS} -D_IOLIB=2 -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE_SOURCE"
  12 generic_CFLAGS="-Wall -L."
  13
  14 AC_ARG_ENABLE(norazf, [  --disable-razf   disable razf support],
  15                           [user_DFLAGS="${user_DFLAGS} -D_NO_RAZF"], [])
  16 AC_ARG_ENABLE(nocurses, [  --disable-curses       disable curses support],
  17                           [user_DFLAGS="${user_DFLAGS} -D_NO_CURSES"], [])
  18 CFLAGS="${generic_CFLAGS} ${user_CFLAGS}"
  19 CXXFLAGS=$CFLAGS
  20
  21 AC_STDC_HEADERS
  22 AC_CHECK_FUNCS([bzero memset pow sqrt strcasecmp strdup strstr strtol])
  23 AC_CHECK_HEADERS([zlib.h fcntl.h malloc.h stddef.h])
  24 AC_CHECK_TYPES([ptrdiff_t])
  25 AC_C_CONST
  26 AC_C_INLINE
  27 AC_FUNC_FSEEKO
  28 AC_FUNC_MALLOC
  29 AC_FUNC_MEMCMP
  30 AC_FUNC_REALLOC
  31 AC_HEADER_STDBOOL
  32 AC_TYPE_OFF_T
  33 AC_TYPE_SIZE_T
  34
  35 AC_OUTPUT([Makefile misc/Makefile])