]> git.donarmstrong.com Git - samtools.git/blob - INSTALL
* update Makefile
[samtools.git] / INSTALL
1 System Requirements
2 ===================
3
4 Most of SAMtools functionality only depends on zlib which is included in
5 this source code package. Compiling the alignment viewer further
6 requires the GNU ncurses library <http://www.gnu.org/software/ncurses/>,
7 which comes with Mac OS X and most of the modern Linux/Unix
8 distributions. If you do not have this library installed, you can still
9 compile the rest of SAMtools by manually modifying two lines in Makefile
10 as is described in the Makefile.
11
12
13 Compilation
14 ===========
15
16 Type `make' to compile samtools.
17
18
19 Installation
20 ============
21
22 Simply copy `samtools' and other executables/scripts in `misc' to a
23 location you want (e.g. a directory in your $PATH). No further
24 configurations are required.