]> git.donarmstrong.com Git - samtools.git/blob - AUTHORS
update information...
[samtools.git] / AUTHORS
1 Heng Li from the Sanger Institute wrote most of the initial source codes
2 of SAMtools and various converters.
3
4 Bob Handsaker from the Broad Institute is a major contributor to the
5 SAM/BAM specification. He designed and implemented the BGZF format, the
6 underlying indexable compression format for the BAM format. BGZF does
7 not support arithmetic between file offsets.
8
9 Jue Ruan for the Beijing Genome Institute designed and implemented the
10 RAZF format. This is an alternative indexable compression format. It
11 supports arithmetic between file offsets, at the cost of increased index
12 file size and the full compatibility with gzip. RAZF is optional and
13 only used in `faidx' for indexing RAZF compressed fasta files.
14
15 Colin Hercus updated novo2sam.pl to support gapped alignment by
16 novoalign.