rsem v1.1.15

[rsem.git] / sam / Makefile

diff --git a/sam/Makefile b/sam/Makefile
index db183330d1fb76ce4fa0d17d8dab65afdfbeb65a..bb89e00da2ed01bf2a44ff488f911ac528f32a62 100644 (file)
--- a/sam/Makefile
+++ b/sam/Makefile
@@ -1,6 +1,13 @@
 CC=                    gcc
-CFLAGS=                -g -Wall -O2 #-m64 #-arch ppc
-DFLAGS=                -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE -D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1
+
+CFLAGS_EXTRA=
+#CFLAGS_EXTRA= -L/usr/include/ncurses
+CFLAGS=                -g -Wall -O2 $(CFLAGS_EXTRA) #-m64 #-arch ppc
+
+DFLAGS_EXTRA=
+#DFLAGS_EXTRA= -Dexpl=exp -Dlogl=log
+DFLAGS=                -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE64_SOURCE -D_USE_KNETFILE -D_CURSES_LIB=1 $(DFLAGS_EXTRA)
+
 KNETFILE_O=    knetfile.o
 LOBJS=         bgzf.o kstring.o bam_aux.o bam.o bam_import.o sam.o bam_index.o \
                        bam_pileup.o bam_lpileup.o bam_md.o razf.o faidx.o bedidx.o \