]> git.donarmstrong.com Git - rsem.git/blobdiff - PairedEndQModel.h
rsem-plot-model updated
[rsem.git] / PairedEndQModel.h
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@@ -199,8 +199,6 @@ public:
        }
 
        int getModelType() const { return model_type; }
-
-       bool simulate(int, PairedEndReadQ&, SingleReadQ&, int&);
  
 private:
        static const int model_type = 3;
@@ -405,9 +403,8 @@ bool PairedEndQModel::simulate(int rid, PairedEndReadQ& read, int& sid) {
                readseq2 = qpro->simulate(sampler, mateL2, m2pos, m2dir, qual2, ref);
        }
 
-       std::ostringstream stdout;
-       stdout<<rid<<"_"<<dir<<"_"<<sid<<"_"<<pos<<"_"<<insertL;
-       name = stdout.str();
+       strout<<rid<<"_"<<dir<<"_"<<sid<<"_"<<pos<<"_"<<insertL;
+       name = strout.str();
 
        read = PairedEndReadQ(SingleReadQ(name + "/1", readseq1, qual1), SingleReadQ(name + "/2", readseq2, qual2));