]> git.donarmstrong.com Git - paml.git/blob - dat/grantham.dat
import paml4.8
[paml.git] / dat / grantham.dat
1  \r
2 111  \r
3 111  85  \r
4 126  96  23  \r
5 195 180 139 154  \r
6  91  43  46  61 154  \r
7 107  54  41  45 170  29  \r
8  60 125  79  94 158  87  98  \r
9  86  29  68  81 174  24  41  98  \r
10  94  98 149 168 197 109 134 136  94  \r
11  96 102 153 172 198 113 139 138  99   5  \r
12 106  26  94 102 202  53  57 127  32 102 107  \r
13  85  92 141 160 196 101 126 127  86  10  14  95  \r
14 113  97 158 177 205 116 140 153 100  21  22 102  29  \r
15  27 103  90 108 169  75  94  42  76  96  98 103  87 114  \r
16  99 109  46  66 112  68  80  55  89 142 144 121 135 155  73  \r
17  58  71  65  85 149  41  66  59  47  89  92  78  81 103  38  58  \r
18 148 101 174 191 215 130 152 184 115  61  61 110  67  40 147 177 129  \r
19 112  77 142 160 194  99 123 147  83  33  36  85  35  22 110 143  92  37  \r
20  65  96 133 152 191  96 121 109  84  30  32  97  22  50  68 123  70  88  55  \r
21 \r
22  A   R   N   D   C   Q   E   G   H   I   L   K   M   F   P   S   T   W   Y   V\r
23 Ala Arg Asn Asp Cys Gln Glu Gly His Ile Leu Lys Met Phe Pro Ser Thr Trp Tyr Val\r
24 \r
25 \r
26 Table 1 in Grantham (1974).\r
27 \r
28         c       p       v      aromaticity (from Xuhua Xia)\r
29 \r
30 Ala     0       8.1     31      -0.11    \r
31 Arg     .65     10.5    124     0.079    \r
32 Asn     1.33    11.6    56      -0.136   \r
33 Asp     1.38    13.0    54      -0.285   \r
34 Cys     2.75    5.5     55      -0.184   \r
35 Gln     .89     10.5    85      -0.067   \r
36 Glu     .92     12.3    83      -0.246   \r
37 Gly     .74     9.0     3       -0.073   \r
38 His     .58     10.4    96      0.32     \r
39 Ile     0       5.2     111     0.001    \r
40 Leu     0       4.9     111     -0.008   \r
41 Lys     .33     11.3    119     0.049    \r
42 Met     0       5.7     105     -0.041   \r
43 Phe     0       5.2     132     0.438    \r
44 Pro     .39     8.0     32.5    -0.016   \r
45 Ser     1.42    9.2     32      -0.153   \r
46 Thr     .71     8.6     61      -0.208   \r
47 Trp     .13     5.4     170     0.493    \r
48 Tyr     .20     6.2     136     0.381    \r
49 Val     0       5.9     84      -0.155   \r