sphinx/whoisusingit.rst

   1 .. -*- mode: rst; fill-column: 78; indent-tabs-mode: nil -*-
   2 .. vi: set ft=rst sts=4 ts=4 sw=4 et tw=79:
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   4   #
   5   #   See COPYING file distributed along with the NeuroDebian package for the
   6   #   copyright and license terms.
   7   #
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  11 .. index:: Who is using it?, Publications
  12 .. _chap_whoisusingit:
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  14 ****************
  15 Who Is Using It?
  16 ****************
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  18
  19 .. only:: html
  20
  21   If you are using NeuroDebian or have published a study employing it, please
  22   leave a comment at the bottom of this page, if you want to be listed here as
  23   well.
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  25
  26 Tools and systems built atop NeuroDebian
  27 ========================================
  28
  29 * ref:`Nemoto et al., BMC Medical Imaging (2011) <NDR+2011>`: Lin4Neuro: a
  30   customized Linux distribution ready for neuroimaging analysis.
  31
  32 * ref:`Stoner et al., Frontiers in Neuroinformatics (2012) <SLZ+2011>`:
  33   A cloud-based data-sharing and analysis cyberinfrastructure for
  34   neuroinformatics.
  35
  36 Articles referring to NeuroDebian
  37 =================================
  38
  39 * :ref:`Yamazaki et al., NeuralNetworks (2011) <YIO+2012>`: Simulation platform:
  40   A cloud-based online simulation environment.
  41
  42 * ref:`Aguirre, NeuroImage (2012) <Agu2012>`: FIASCO, VoxBo, and MEDx: Behind
  43   the code.
  44
  45 * ref:`Mathôt et al., Behavioral Research Methods (2012) <MST2012>`: OpenSesame:
  46   An open-source, graphical experiment builder for the social sciences.
  47
  48 * ref:`Minervini et al., Image Processing Theory, Tools and Applications (2012)
  49   <MDT+2012>`: Mouse neuroimaging phenotyping in the cloud.
  50
  51 * ref:`Galluppi et al., Computing Frontiers (2012) <GDS+2012>`: A hierachical
  52   configuration system for a massively parallel neural hardware platform.
  53
  54 * ref:`Cauda et al., NeuroImage (2012) <CCT+2012>`: Meta-analytic clustering of
  55   the insular cortex Characterizing the meta-analytic connectivity of the insula
  56   when involved in active tasks.
  57
  58 * ref:`Gingnell et al., Psychoneuroendocrinology (2012) <GEF+2012>`: Oral
  59   contraceptive use changes brain activity and mood in women with previous
  60   negative affect on the pill—A double-blinded, placebo-controlled randomized
  61   trial of a levonorgestrel-containing combined oral contraceptive.
  62
  63 * ref:`Gingnell et al., Hormones and Behavior (2012) <GMB+2012>`: Menstrual
  64   cycle effects on amygdala reactivity to emotional stimulation in premenstrual
  65   dysphoric disorder.
  66
  67 * ref:`Milham, Neuron, (2012) <Mil2012>`: Open Neuroscience Solutions for the
  68   Connectome-wide Association Era.
  69
  70 * ref:`Visan, Computer Science Dissertations (2012) <Vis2012>`: Temporal
  71   meta-programming: treating time as a spatial dimension.
  72
  73 * ref:`Gerhard et al., Frontiers in Neuroinformatics (2011) <GDL+2011>`: The
  74   connectome viewer toolkit: an open source framework to manage, analyze, and
  75   visualize connectomes.
  76
  77 * ref:`Soh et al., Journal of Integrative Bioinformatics (2011) <SMT+2011>`:
  78   Integrative visualization of temporally varying medical image patterns.
  79
  80 * ref:`Gosh et al., HBM (2010) <GBC+2010>`: Nipype: opensource platform for
  81   unified and replicable interaction with existing neuroimaging tools.
  82