sphinx/testimonials.rst

   1 .. _testimonials:
   2
   3 Testimonials
   4 ============
   5
   6 Here is some feedback we got from the neuroscience community on various
   7 occasions. On this page it is grouped by its origin (i.e.  `research
   8 institutions`_, `research software projects`_, `individual laboratories and
   9 researchers`_). Alternatively, you can read testimonials related to specific
  10 topics:
  11
  12 * :ref:`testimonials_open_science`
  13 * :ref:`testimonials_standardization`
  14 * :ref:`testimonials_vm`
  15
  16 .. None so far replied
  17 ..
  18 .. Organizations
  19 .. -------------
  20 ..
  21 .. .. quotes::
  22 ..    :group: Organizations
  23
  24
  25 Research Institutions
  26 ---------------------
  27
  28 .. quotes::
  29    :group: Research institutions
  30
  31 ..   not implemented for now
  32 ..   :sections: group
  33
  34 .. quote::
  35     :author: Christian Haselgrove
  36     :affiliation: Vice President for Neuroinformatics at
  37                                   Neuromorphometrics, Inc; University of Massachusetts Medical School
  38     :date: 2013-02-06
  39     :tags: email, derivatives, management
  40
  41     Developing informatics infrastructure often involves building
  42     complex systems that require interaction between existing
  43     components such as software and atlases.  NeuroDebian makes it
  44     trivial to manage the components of these systems, freeing me to
  45     focus on the novel and important aspects of my work.
  46
  47
  48 Research Software Projects
  49 --------------------------
  50
  51 .. quotes::
  52    :group: Research software projects
  53
  54
  55 .. quote::
  56    :author: Stephan Gerhard, et al.
  57    :date: 2011-06-06
  58    :tags:  practices, quality
  59    :source: The Connectome Viewer Toolkit, Front. Neuroinform. 5:3. doi: 10.3389/fninf.2011.00003
  60
  61    For proper software packaging and distribution, the NeuroDebian project provides professional expertise and infrastructure.
  62
  63 .. quote::
  64    :author: Chuck Theobald
  65    :affiliation: Lewis Center for Neuroimaging, University of Oregon, MRIConvert/mcverter build master and developer
  66    :tags: email, impact, software distribution, upstream, dissemination
  67    :date: 2013-02-06
  68
  69    As a system administrator, I support the efforts of a number of
  70    researchers who use fMRI analysis software. I was overjoyed to find
  71    the NeuroDebian repository, a one-stop shop for nearly every
  72    software package the researchers use. The work of the NeuroDebian
  73    Team greatly simplifies the task of providing our researchers the
  74    best software available, and I consider the repository a vital part
  75    of my professional life.  As a maintainer on the MRIConvert
  76    project, I find that NeuroDebian provides a valuable venue for
  77    dissemination of our software. It would not be possible to reach
  78    the same wide audience without the NeuroDebian repository.
  79
  80 .. quote::
  81     :author: Dr. Kiyotaka Nemoto
  82     :affiliation: University of Tsukuba
  83     :tags: email, derivatives, time
  84     :date: 2013-02-06
  85
  86     Neurodebian is the best solution for researchers in neuroscience.
  87     Everybody should have experienced wasting so much time in just setting
  88     up software. With Neurodebian repository, you can easily setup many
  89     useful software packages and focus on your research. I recommend this
  90     repository to everyone who is interested in using Linux in
  91     neuroscience.
  92
  93 .. quote::
  94     :author: Dr. Andrew Janke
  95     :affiliation: Center for Advanced Imaging, University of Queensland, Australia
  96     :date: 2013-02-06
  97     :tags: email, upstream, stability, versioning, provenance, vm,
  98                    reproducibility, collaboration
  99
 100     We use NeuroDebian on a daily basis as it provides a stable and
 101     versioned software base for analysis. This is critical as it allows us
 102     to maintain data provenance, something that is often sorely lacking.
 103     Our collaborators who don't quite have their heads around Linux yet
 104     are pointed to the NeuroDebian Virtual Machine, it allows them to run
 105     an identical analysis environment to us regardless of where they are
 106     or operating system.
 107
 108 .. quote::
 109    :author: Nina Preuss
 110    :affiliation: PMP, nitrc.org
 111    :date: 2013-02-06
 112    :tags: disqus, money, quality, contributions, cloud, derivatives
 113
 114     NITRC-CE, or the NITRC Computational Environment, on the Amazon
 115     Marketplace wouldn't have happened as quickly and thus cost effectively
 116     without leveraging NeuroDebian's good works. We appreciate their
 117     critical contribution to the neuroimaging compute community.
 118
 119 .. quote::
 120    :author: Sebastiaan Mathôt
 121    :affiliation: Aix-Marseille université, Laboratoire de Psychologie Cognitive
 122    :date: 2013-02-06
 123    :tags: email, impact
 124
 125    For any neuroscientist that relies on open-source software,
 126    NeuroDebian is the single most important resource.
 127
 128 .. quote::
 129    :author: Sebastian Eichelbaum
 130    :affiliation: OpenWalnut project, Image and Signal Processing Group, Institute of Computer Science, University of Leipzig, Germany
 131    :date: 2013-02-11
 132    :tags: email, breadth, dissemination
 133
 134    With NeuroDebian we can utilize thousands of tools, providing the foundation for our research. On the other hand, we can provide our tools to a large community easily.
 135
 136
 137 .. quote::
 138    :author: Francisco Pereira
 139    :affiliation: Siemens Corporate Research
 140    :date: 2013-02-06
 141    :tags: gplus, time
 142
 143    Thanks to NeuroDebian I now have to spend my time thinking hard about what to do with the tools, rather than leisurely installing them and tracking dependencies.
 144
 145 .. quote::
 146    :author: Alexander Wiebel
 147    :affiliation: OpenWalnut project, Zuse Institute Berlin (ZIB), Germany
 148    :date: 2013-02-19
 149    :tags: email, breadth, dissemination
 150
 151    It is great to have NeuroDebian as a platform to bring our
 152    visualization system OpenWalnut to a broad audience together with the large variety of
 153    related data analysis tools available in NeuroDebian.
 154
 155
 156
 157 Individual Laboratories and Researchers
 158 ---------------------------------------
 159
 160 .. quotes::
 161    :group: Individual laboratories and researchers
 162
 163
 164 .. quote::
 165    :author: Prof. Petr Hlustik
 166    :affiliation: Departments of Neurology and Radiology, Palacky University School of Medicine and University Hospital, Olomouc, Czech Republic
 167    :date: 2010-10-11
 168    :tags: breadth
 169
 170    [...] those wonderful tools in Debian Neuro [...] make my life as a
 171    researcher who also maintains a bunch of Debian boxes so much easier.
 172
 173 .. quote::
 174    :author: Dr. Jo Etzel
 175    :affiliation: Department of Psychology, Washington University
 176    :date: 2012-03-15
 177    :tags: vm
 178
 179    I am a dedicated R user ... and have a Windows box. But this
 180    afternoon I (finally) downloaded and installed NeuroDebian and the
 181    VirtualBox, ran AFNI, and generated the files I needed, all within
 182    about an hour and a half. [...] not bad, considering that I know
 183    essentially no Linux/Unix. So here's a big "thanks!" :)
 184
 185 .. quote::
 186   :author: Vincent Kersten
 187   :affiliation: University Medical Center Utrecht
 188   :tags: email, standardization, money, Debian
 189   :date: 2013-02-06
 190
 191   Neurodebian provides us with a consitent way of sotware packaging
 192   and upgrades, eliminating tedious compiles and home-brew setups,
 193   while seamlessly integrating with the Debian distribution. Excellent
 194   and very valuable work, saving costs and difficult to spot
 195   errors. High five Michael, Yaroslav and team! Keep them packages
 196   coming!
 197
 198 .. quote::
 199    :author: Christian Stephan-Otto
 200    :affiliation: Neuroimaging Research Group, Parc Sanitari Sant Joan de Deu, Barcelona, Spain
 201    :date: 2013-02-06
 202    :tags: email, vm, breadth
 203
 204    Since I started using a NeuroDebian virtual machine on win64 months
 205    ago I am relying more and more on its diverse tools, from
 206    population-specific template creation to pipelining the analysis of
 207    fMRI, DTI and morphology studies. There is a great chance I will
 208    end up working exclusively with NeuroDebian!
 209
 210 .. quote::
 211    :author: Mathias Goldau
 212    :affiliation: Cortical Networks, Max-Planck-Institute for neurological research, Cologne, Germany
 213    :date: 2013-02-07
 214    :tags: email, time, breadth
 215
 216    Without NeuroDebian we would have wasted precious time for
 217    deploying software, and we wouldn't have tested so many software
 218    tools.
 219
 220 .. quote::
 221    :author: Joseph Viviano
 222    :affiliation: York University, Toronto Canada
 223    :date: 2013-02-19
 224    :tags: email, reproducibility, versioning, impact
 225
 226    NeuroDebian not only helped our lab focus on research and producing
 227    results with FOSS, it has also made it much easier to maintain
 228    version control, facilitating data portability and
 229    reproducibility. I see this as the most important current project
 230    working towards transparent neuroscientific methods with clear and
 231    reproducible results.
 232
 233 .. quote::
 234    :author: Dr. Bertram Walter
 235    :affiliation: Bender Institute of Neuroimaging, University of Giessen, Germany
 236    :date: 2013-02-22
 237    :tags: email, money, maintenance, support, quality
 238
 239    Neurodebian provides not only a platform for neuroscience
 240    applications that makes maintenance of collections of tools
 241    easy. The staff also gives a very quick support in case of - very
 242    rare - problems.  Altogether Neurodebian saves a lot of time and
 243    money.