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- 2 , // [103] = g (Nucleotide)
- INVALID_LETTER, // [104] = 104
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- };
-
-unsigned char g_LetterToCharNucleo[256] =
- {
- 'A', // [0]
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- 'T', // [3]
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- };
-
-unsigned g_CodonWordToAminoLetter[4*4*4] =
- {
- 8 , // [ 0] = AAA K (Lys)
- 11, // [ 1] = AAC N (Asn)
- 8 , // [ 2] = AAG K (Lys)
- 11, // [ 3] = AAT N (Asn)
- 16, // [ 4] = ACA T (Thr)
- 16, // [ 5] = ACC T (Thr)
- 16, // [ 6] = ACG T (Thr)
- 16, // [ 7] = ACT T (Thr)
- 14, // [ 8] = AGA R (Arg)
- 15, // [ 9] = AGC S (Ser)
- 14, // [10] = AGG R (Arg)
- 15, // [11] = AGT S (Ser)
- 7 , // [12] = ATA I (Ile)
- 7 , // [13] = ATC I (Ile)
- 10, // [14] = ATG M (Met)
- 7 , // [15] = ATT I (Ile)
- 13, // [16] = CAA Q (Gln)
- 6 , // [17] = CAC H (His)
- 13, // [18] = CAG Q (Gln)
- 6 , // [19] = CAT H (His)
- 12, // [20] = CCA P (Pro)
- 12, // [21] = CCC P (Pro)
- 12, // [22] = CCG P (Pro)
- 12, // [23] = CCT P (Pro)
- 14, // [24] = CGA R (Arg)
- 14, // [25] = CGC R (Arg)
- 14, // [26] = CGG R (Arg)
- 14, // [27] = CGT R (Arg)
- 9 , // [28] = CTA L (Leu)
- 9 , // [29] = CTC L (Leu)
- 9 , // [30] = CTG L (Leu)
- 9 , // [31] = CTT L (Leu)
- 3 , // [32] = GAA E (Glu)
- 2 , // [33] = GAC D (Asp)
- 3 , // [34] = GAG E (Glu)
- 2 , // [35] = GAT D (Asp)
- 0 , // [36] = GCA A (Ala)
- 0 , // [37] = GCC A (Ala)
- 0 , // [38] = GCG A (Ala)
- 0 , // [39] = GCT A (Ala)
- 5 , // [40] = GGA G (Gly)
- 5 , // [41] = GGC G (Gly)
- 5 , // [42] = GGG G (Gly)
- 5 , // [43] = GGT G (Gly)
- 17, // [44] = GTA V (Val)
- 17, // [45] = GTC V (Val)
- 17, // [46] = GTG V (Val)
- 17, // [47] = GTT V (Val)
- 20, // [48] = TAA * (STP)
- 19, // [49] = TAC Y (Tyr)
- 20, // [50] = TAG * (STP)
- 19, // [51] = TAT Y (Tyr)
- 15, // [52] = TCA S (Ser)
- 15, // [53] = TCC S (Ser)
- 15, // [54] = TCG S (Ser)
- 15, // [55] = TCT S (Ser)
- 20, // [56] = TGA * (STP)
- 1 , // [57] = TGC C (Cys)
- 18, // [58] = TGG W (Trp)
- 1 , // [59] = TGT C (Cys)
- 9 , // [60] = TTA L (Leu)
- 4 , // [61] = TTC F (Phe)
- 9 , // [62] = TTG L (Leu)
- 4 , // [63] = TTT F (Phe)
- };
-
-char g_CodonWordToAminoChar[4*4*4] =
- {
- 'K', // [ 0] = AAA (Lys)
- 'N', // [ 1] = AAC (Asn)
- 'K', // [ 2] = AAG (Lys)
- 'N', // [ 3] = AAT (Asn)
- 'T', // [ 4] = ACA (Thr)
- 'T', // [ 5] = ACC (Thr)
- 'T', // [ 6] = ACG (Thr)
- 'T', // [ 7] = ACT (Thr)
- 'R', // [ 8] = AGA (Arg)
- 'S', // [ 9] = AGC (Ser)
- 'R', // [10] = AGG (Arg)
- 'S', // [11] = AGT (Ser)
- 'I', // [12] = ATA (Ile)
- 'I', // [13] = ATC (Ile)
- 'M', // [14] = ATG (Met)
- 'I', // [15] = ATT (Ile)
- 'Q', // [16] = CAA (Gln)
- 'H', // [17] = CAC (His)
- 'Q', // [18] = CAG (Gln)
- 'H', // [19] = CAT (His)
- 'P', // [20] = CCA (Pro)
- 'P', // [21] = CCC (Pro)
- 'P', // [22] = CCG (Pro)
- 'P', // [23] = CCT (Pro)
- 'R', // [24] = CGA (Arg)
- 'R', // [25] = CGC (Arg)
- 'R', // [26] = CGG (Arg)
- 'R', // [27] = CGT (Arg)
- 'L', // [28] = CTA (Leu)
- 'L', // [29] = CTC (Leu)
- 'L', // [30] = CTG (Leu)
- 'L', // [31] = CTT (Leu)
- 'E', // [32] = GAA (Glu)
- 'D', // [33] = GAC (Asp)
- 'E', // [34] = GAG (Glu)
- 'D', // [35] = GAT (Asp)
- 'A', // [36] = GCA (Ala)
- 'A', // [37] = GCC (Ala)
- 'A', // [38] = GCG (Ala)
- 'A', // [39] = GCT (Ala)
- 'G', // [40] = GGA (Gly)
- 'G', // [41] = GGC (Gly)
- 'G', // [42] = GGG (Gly)
- 'G', // [43] = GGT (Gly)
- 'V', // [44] = GTA (Val)
- 'V', // [45] = GTC (Val)
- 'V', // [46] = GTG (Val)
- 'V', // [47] = GTT (Val)
- '*', // [48] = TAA (STP)
- 'Y', // [49] = TAC (Tyr)
- '*', // [50] = TAG (STP)
- 'Y', // [51] = TAT (Tyr)
- 'S', // [52] = TCA (Ser)
- 'S', // [53] = TCC (Ser)
- 'S', // [54] = TCG (Ser)
- 'S', // [55] = TCT (Ser)
- '*', // [56] = TGA (STP)
- 'C', // [57] = TGC (Cys)
- 'W', // [58] = TGG (Trp)
- 'C', // [59] = TGT (Cys)
- 'L', // [60] = TTA (Leu)
- 'F', // [61] = TTC (Phe)
- 'L', // [62] = TTG (Leu)
- 'F', // [63] = TTT (Phe)
- };
-
-unsigned char g_CharToCompChar[256] =
- {
- INVALID_CHAR, // [ 0]
- INVALID_CHAR, // [ 1]
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- INVALID_CHAR, // [ 57]
- INVALID_CHAR, // [ 58]
- INVALID_CHAR, // [ 59]
- INVALID_CHAR, // [ 60]
- INVALID_CHAR, // [ 61]
- INVALID_CHAR, // [ 62]
- INVALID_CHAR, // [ 63]
- INVALID_CHAR, // [ 64]
- 'T', // [ 65] A -> T
- INVALID_CHAR, // [ 66]
- 'G', // [ 67] C -> G
- INVALID_CHAR, // [ 68]
- INVALID_CHAR, // [ 69]
- INVALID_CHAR, // [ 70]
- 'C', // [ 71] G -> C
- INVALID_CHAR, // [ 72]
- INVALID_CHAR, // [ 73]
- INVALID_CHAR, // [ 74]
- INVALID_CHAR, // [ 75]
- INVALID_CHAR, // [ 76]
- INVALID_CHAR, // [ 77]
- INVALID_CHAR, // [ 78]
- INVALID_CHAR, // [ 79]
- INVALID_CHAR, // [ 80]
- INVALID_CHAR, // [ 81]
- INVALID_CHAR, // [ 82]
- INVALID_CHAR, // [ 83]
- 'A', // [ 84] T -> A
- 'A', // [ 85] U -> A
- INVALID_CHAR, // [ 86]
- INVALID_CHAR, // [ 87]
- INVALID_CHAR, // [ 88]
- INVALID_CHAR, // [ 89]
- INVALID_CHAR, // [ 90]
- INVALID_CHAR, // [ 91]
- INVALID_CHAR, // [ 92]
- INVALID_CHAR, // [ 93]
- INVALID_CHAR, // [ 94]
- INVALID_CHAR, // [ 95]
- INVALID_CHAR, // [ 96]
- 'T', // [ 97] a -> T
- INVALID_CHAR, // [ 98]
- 'G', // [ 99] c -> G
- INVALID_CHAR, // [100]
- INVALID_CHAR, // [101]
- INVALID_CHAR, // [102]
- 'C', // [103] g -> C
- INVALID_CHAR, // [104]
- INVALID_CHAR, // [105]
- INVALID_CHAR, // [106]
- INVALID_CHAR, // [107]
- INVALID_CHAR, // [108]
- INVALID_CHAR, // [109]
- INVALID_CHAR, // [110]
- INVALID_CHAR, // [111]
- INVALID_CHAR, // [112]
- INVALID_CHAR, // [113]
- INVALID_CHAR, // [114]
- INVALID_CHAR, // [115]
- 'A', // [116] t -> A
- 'A', // [117] u -> A
- INVALID_CHAR, // [118]
- INVALID_CHAR, // [119]
- INVALID_CHAR, // [120]
- INVALID_CHAR, // [121]
- INVALID_CHAR, // [122]
- INVALID_CHAR, // [123]
- INVALID_CHAR, // [124]
- INVALID_CHAR, // [125]
- INVALID_CHAR, // [126]
- INVALID_CHAR, // [127]
- INVALID_CHAR, // [128]
- INVALID_CHAR, // [129]
- INVALID_CHAR, // [130]
- INVALID_CHAR, // [131]
- INVALID_CHAR, // [132]
- INVALID_CHAR, // [133]
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