]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - treemap.h
fixed multiple bugs for 1.4 release
[mothur.git] / treemap.h
index 73d02fcc4b0c58f29de00c130e3fa8a197dd3d53..8f744c80a3e92873699aca320032cedeea59a007 100644 (file)
--- a/treemap.h
+++ b/treemap.h
@@ -11,6 +11,7 @@
 
 #include "mothur.h"
 #include "groupmap.h"
+#include "listvector.hpp"
 
 /* This class is used by the read.tree command to build the tree container. */
 
@@ -20,6 +21,7 @@ struct GroupIndex {
 };
 
 class GroupMap;
+class ListVector;
 
 class TreeMap {
 public:
@@ -39,7 +41,7 @@ public:
        map<string, GroupIndex> treemap; //sequence name and <groupname, vector index>
        void print(ostream&);
        void makeSim(GroupMap*);  //takes groupmap info and fills treemap for use by tree.shared command.
-       
+       void makeSim(ListVector*);  //takes listvector info and fills treemap for use by tree.shared command.   
        
 private:
        ifstream fileHandle;