]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - seqsummarycommand.h
added load.logfile command. changed summary.single output for subsample=t.
[mothur.git] / seqsummarycommand.h
index dcae434d42d08e38f223292a5c2647428e1d9475..79e8be96974141da315d1038a51096695212ad5c 100644 (file)
@@ -25,6 +25,7 @@ public:
        vector<string> setParameters();
        string getCommandName()                 { return "summary.seqs";                        }
        string getCommandCategory()             { return "Sequence Processing";         }
+       string getOutputFileNameTag(string, string);
        string getHelpString(); 
        string getCitation() { return "http://www.mothur.org/wiki/Summary.seqs"; }
        string getDescription()         { return "summarize the quality of sequences in an unaligned or aligned fasta file"; }
@@ -91,7 +92,7 @@ struct seqSumData {
 };
 
 /**************************************************************************************************/
-#if defined (__APPLE__) || (__MACH__) || (linux) || (__linux)
+#if defined (__APPLE__) || (__MACH__) || (linux) || (__linux) || (__linux__) || (__unix__) || (__unix)
 #else
 static DWORD WINAPI MySeqSumThreadFunction(LPVOID lpParam){ 
        seqSumData* pDataArray;