]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - parsimonycommand.h
working on citations
[mothur.git] / parsimonycommand.h
index 30c8332c8285466c7571c4ca275977e47f3469fe..5e5484f4687474886730e437ea3d44d6aced3ccb 100644 (file)
@@ -29,7 +29,7 @@ public:
        string getCommandName()                 { return "parsimony";                           }
        string getCommandCategory()             { return "Hypothesis Testing";          }
        string getHelpString(); 
-       string getCitation() { return "http://www.mothur.org/wiki/Parsimony"; }
+       string getCitation() { return "Slatkin M, Maddison WP (1989). A cladistic measure of gene flow inferred from the phylogenies of alleles. Genetics 123: 603-13. \nSlatkin M, Maddison WP (1990). Detecting isolation by distance using phylogenies of genes. Genetics 126: 249-60. \nMartin AP (2002). Phylogenetic approaches for describing and comparing the diversity of microbial communities. Appl Environ Microbiol 68: 3673-82. \nSchloss PD, Handelsman J (2006). Introducing TreeClimber, a test to compare microbial community structure. Appl Environ Microbiol 72: 2379-84.\nhttp://www.mothur.org/wiki/Parsimony"; }
        
        int execute();
        void help() { m->mothurOut(getHelpString()); }