void NastReport::setCandidate(Sequence* candSeq){
queryName = candSeq->getName();
- queryLength = candSeq->getUnalignLength();
+ queryLength = candSeq->getNumBases();
}
/******************************************************************************************************************/
void NastReport::setTemplate(Sequence* tempSeq){
templateName = tempSeq->getName();
- templateLength = tempSeq->getUnalignLength();
+ templateLength = tempSeq->getNumBases();
}
/******************************************************************************************************************/