]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - mantelcommand.h
changes while testing
[mothur.git] / mantelcommand.h
index adffda857c4e4aa64ceb38c502f011d7ecefed2e..33fa3ea21e91fa2663994947720080933fad3d61 100644 (file)
@@ -22,9 +22,11 @@ public:
        vector<string> setParameters();
        string getCommandName()                 { return "mantel";                                      }
        string getCommandCategory()             { return "Hypothesis Testing";          }
+       
        string getHelpString(); 
+    string getOutputPattern(string);   
        string getCitation() { return "McCune B, Grace JB, Urban DL (2002). Analysis of ecological communities. MjM Software Design: Gleneden Beach, OR. \nLegendre P, Legendre L (1998). Numerical Ecology. Elsevier: New York. \nhttp://www.mothur.org/wiki/Mantel"; }
-       string getDescription()         { return "mantel"; }
+       string getDescription()         { return "Mantel’s test for correlation between matrices"; }
 
        int execute();
        void help() { m->mothurOut(getHelpString()); }