]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - knn.cpp
changes while testing
[mothur.git] / knn.cpp
diff --git a/knn.cpp b/knn.cpp
index 837fa6d18d4f1aed6cf34e5861942b4230c30dd1..81b21b265785c2f8a83392ee52e7aeffbc9d4370 100644 (file)
--- a/knn.cpp
+++ b/knn.cpp
@@ -14,6 +14,7 @@ Knn::Knn(string tfile, string tempFile, string method, int kmerSize, float gapOp
 : Classify(), num(n), search(method) {
        try {
                threadID = tid;
+        shortcuts = true;
                
                //create search database and names vector
                generateDatabaseAndNames(tfile, tempFile, method, kmerSize, gapOpen, gapExtend, match, misMatch);