]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - indicatorcommand.h
added load.logfile command. changed summary.single output for subsample=t.
[mothur.git] / indicatorcommand.h
index c5112e683dbf78a074aa1df6c1978d3b1fb0756d..2c36c35f6f3025bb3f07760055512b2e0e257914 100644 (file)
@@ -26,6 +26,7 @@ public:
        vector<string> setParameters();
        string getCommandName()                 { return "indicator";                           }
        string getCommandCategory()             { return "Hypothesis Testing";          }
+       string getOutputFileNameTag(string, string);
        string getHelpString(); 
        string getCitation() { return "Dufrene M, Legendre P (1997). Species assemblages and indicator species: The need for a flexible asymmetrical approach. Ecol Monogr 67: 345-66.\n McCune B, Grace JB, Urban DL (2002). Analysis of ecological communities. MjM Software Design: Gleneden Beach, OR. \nLegendre P, Legendre L (1998). Numerical Ecology. Elsevier: New York. \nhttp://www.mothur.org/wiki/Indicator"; }
        string getDescription()         { return "calculate the indicator value for each OTU"; }