]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - helpcommand.cpp
added log10 and log2 scalers for heatmap
[mothur.git] / helpcommand.cpp
index 7ac616feb6cc82be610c73a7e853d50a17693998..9e85590bc2854aae88d46ce711a9f080ab5b04a6 100644 (file)
@@ -203,7 +203,7 @@ int HelpCommand::execute(){
                cout << "Example heatmap(groups=A-B-C, line=1-3-5, sorted=0, scaler=log10)." << "\n";
                cout << "The default value for groups is all the groups in your groupfile, and all lines in your inputfile will be used." << "\n";
                cout << "The default value for sorted is 1 meaning you want the shared otus on top, you may change it to 0 meaning the exact representation of your input file." << "\n";
-               cout << "The default value for scaler is log2; your other options are log10 and linear." << "\n";
+               cout << "The default value for scaler is log10; your other options are log2 and linear." << "\n";
                cout << "The heatmap command outputs a .svg file for each line or label you specify." << "\n";
                cout << "Note: No spaces between parameter labels (i.e. groups), '=' and parameters (i.e.yourGroups)." << "\n" << "\n";
        }else if (globaldata->helpRequest == "venn") {