]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - globaldata.hpp
altered venn command to make use of sharedchao for any number of groups, fixed window...
[mothur.git] / globaldata.hpp
index aa68dc2c1dffd0fe90f82e8eabff554e0c8c0000..801ca6013889e7300d99fa3763ab6701ec4bf530 100644 (file)
@@ -75,6 +75,8 @@ public:
        string getStep();
        string getForm();
        string getSorted();
+       string getEnds();
+       string getProcessors();
 
        string getTrump();
        string getSoft();
@@ -94,6 +96,8 @@ public:
        void setRandomTree(string);
        void setGroups(string);
        void setCalc(string);
+       void setEnds(string);
+       void setProcessors(string);
 
        void clear(); 
        void clearLabels();
@@ -110,7 +114,7 @@ public:
 private:
 
        string phylipfile, columnfile, listfile, rabundfile, sabundfile, namefile, groupfile, orderfile, fastafile, nexusfile, clustalfile, treefile, sharedfile, line, label, randomtree, groups;
-       string cutoff, format, precision, method, fileroot, iters, jumble, freq, calc, abund, step, form, sorted, trump, soft, filter, scale;
+       string cutoff, format, precision, method, fileroot, iters, jumble, freq, calc, abund, step, form, sorted, trump, soft, filter, scale, ends, processors;
 
 
        static GlobalData* _uniqueInstance;