removed read.dist, read.otu, read.tree and globaldata. added current to defaults...

[mothur.git] / globaldata.cpp

diff --git a/globaldata.cpp b/globaldata.cpp
index b18324b8766f9d498295a6e630caaec1b5cc9595..a0b80ecbbf77ef9e8b95b90b558656148651f9fc 100644 (file)
--- a/globaldata.cpp
+++ b/globaldata.cpp
@@ -1,5 +1,5 @@
 
-
+/*
 #include "globaldata.hpp"
 #include "sharedlistvector.h"
 #include "inputdata.h"
@@ -7,7 +7,7 @@
 
 /*******************************************************/
 
-/******************************************************/
+/******************************************************
 GlobalData* GlobalData::getInstance() {
        if( _uniqueInstance == 0) {
                _uniqueInstance = new GlobalData();
@@ -16,7 +16,7 @@ GlobalData* GlobalData::getInstance() {
 }
 /*******************************************************/
 
-/******************************************************/
+/******************************************************
 // These functions give you the option parameters of the commands
 string GlobalData::getPhylipFile()             {       return phylipfile;              }
 string GlobalData::getColumnFile()             {       return columnfile;              }
@@ -49,7 +49,7 @@ void GlobalData::setFormat(string Format)             {       format = Format;                }
 
 /*******************************************************/
 
-/******************************************************/
+/******************************************************
 GlobalData::GlobalData() {
        m = MothurOut::getInstance();
        //option definitions should go here...
@@ -71,7 +71,7 @@ GlobalData::GlobalData() {
 }
 /*******************************************************/
 
-/******************************************************/
+/******************************************************
 void GlobalData::clear() {
        //option definitions should go here...
        phylipfile              =       ""; //do we need this?
@@ -94,7 +94,7 @@ void GlobalData::clear() {
 
 /*******************************************************/
 
-/******************************************************/
+/******************************************************
 void GlobalData::newRead() {
        try{    
                        //remove old file names
@@ -143,7 +143,7 @@ void GlobalData::newRead() {
 
 //******************************************************/
 
-/******************************************************/
+/*****************************************************
 GlobalData::~GlobalData() {
        _uniqueInstance = 0;
        try {