]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - errorchecking.h
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[mothur.git] / errorchecking.h
index 05ce5cf12a071c2e50409dd29c648447465f5bfe..bbc3050f020c8ae10699bb050acca467363b2acf 100644 (file)
@@ -33,8 +33,9 @@ class ErrorCheck {
                void validateBinFiles();
                void clear();
                void refresh();
-               string phylipfile, columnfile, listfile, rabundfile, sabundfile, namefile, groupfile, orderfile, fastafile, treefile, sharedfile, cutoff, format; 
-               string precision, method, fileroot, label, line, iters, jumble, freq, single, rarefaction, shared, summary, randomtree, abund, sorted, scale;
+               string phylipfile, columnfile, listfile, rabundfile, sabundfile, namefile, groupfile, orderfile, fastafile, nexusfile, clustalfile, treefile, sharedfile, cutoff, format; 
+               string precision, method, fileroot, label, line, iters, jumble, freq, single, rarefaction, shared, summary, randomtree, abund, sorted, trump, soft, filter, scale;
+
                string commandName, optionText;
                bool errorFree;