]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - deconvolutecommand.h
working on pam
[mothur.git] / deconvolutecommand.h
index 673ffc9e4d2e689cd32c6b16867089fe43f216d1..e514bdae70f7e0b51854b40baacf44d2b0174c8a 100644 (file)
@@ -27,8 +27,9 @@ public:
        vector<string> setParameters();
        string getCommandName()                 { return "unique.seqs";         }
        string getCommandCategory()             { return "Sequence Processing";         }
-    string getOutputFileNameTag(string, string);
+    
        string getHelpString(); 
+    string getOutputPattern(string);   
        string getCitation() { return "http://www.mothur.org/wiki/Unique.seqs"; }
        string getDescription()         { return "creates a fasta containing the unique sequences as well as a namesfile with the names each sequence represents"; }