]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - classifyotucommand.h
changed random forest output filename
[mothur.git] / classifyotucommand.h
index c08a29b8c71552be73d7bd1d3e28c3b0a1ee2159..c0a822070fa9a8b0b570f05e1ede727e19ead48b 100644 (file)
@@ -26,8 +26,9 @@ public:
        vector<string> setParameters();
        string getCommandName()                 { return "classify.otu";                }
        string getCommandCategory()             { return "Phylotype Analysis";  }
-       string getOutputFileNameTag(string, string);
+       
        string getHelpString(); 
+    string getOutputPattern(string);   
        string getCitation() { return "Schloss PD, Westcott SL (2011). Assessing and improving methods used in OTU-based approaches for 16S rRNA gene sequence analysis. Appl Environ Microbiol 77:3219.\nhttp://www.mothur.org/wiki/Classify.otu"; }
        string getDescription()         { return "find the concensus taxonomy for each OTU"; }