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Merge remote-tracking branch 'mothur/master'
[mothur.git] / chimerauchimecommand.h
index a5b42751dfd74ea3eb1fc3dc4ccf9bfa5bb9822b..f0c30d08a03f1834de06c550668e6b3b1f64c1b1 100644 (file)
@@ -30,7 +30,7 @@ public:
        string getCommandCategory()             { return "Sequence Processing"; }
        string getOutputFileNameTag(string, string);
        string getHelpString(); 
-       string getCitation() { return "uchime by Robert C. Edgar\nhttp://drive5.com/uchime\nThis code is donated to the public domain.\nhttp://www.mothur.org/wiki/Chimera.uchime\nEdgar,R.C., Haas,B.J., Clemente,J.C., Quince,C. and Knight,R. (2011), UCHIME improves sensitivity and speed of chimera detection, Bioinformatics, in press.\n"; }
+       string getCitation() { return "uchime by Robert C. Edgar\nhttp://drive5.com/uchime\nThis code was donated to the public domain.\nEdgar,R.C., Haas,B.J., Clemente,J.C., Quince,C. and Knight,R. (2011), UCHIME improves sensitivity and speed of chimera detection.  Bioinformatics 27:2194.\nhttp://www.mothur.org/wiki/Chimera.uchime\n"; }
        string getDescription()         { return "detect chimeric sequences"; }
        
        int execute();