weighted.h

   1 #ifndef WEIGHTED_H
   2 #define WEIGHTED_H
   3
   4
   5 /*
   6  *  weighted.h
   7  *  Mothur
   8  *
   9  *  Created by Sarah Westcott on 2/9/09.
  10  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
  11  *
  12  */
  13
  14 #include "treecalculator.h"
  15 #include "treemap.h"
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  17 /***********************************************************************/
  18
  19 class Weighted : public TreeCalculator  {
  20
  21         public:
  22                 Weighted(TreeMap* t) : tmap(t) {};
  23                 ~Weighted() {};
  24                 EstOutput getValues(Tree*);
  25                 EstOutput getValues(Tree*, string, string);
  26
  27         private:
  28                 GlobalData* globaldata;
  29                 EstOutput data;
  30                 TreeMap* tmap;
  31                 map<string, int>::iterator it;
  32                 map<string, double> WScore; //a score for each group combination i.e. AB, AC, BC.
  33 };
  34
  35 /***********************************************************************/
  36
  37
  38 #endif