]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blob - source/optionparser.h
facd1f85182cc526a6db01d85968d9231afcfc88
[mothur.git] / source / optionparser.h
1 #ifndef OPTIONPARSER_H
2 #define OPTIONPARSER_H
3
4 /*
5  *  optionparser.h
6  *  Mothur
7  *
8  *  Created by Sarah Westcott on 6/8/09.
9  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
10  *
11  */
12
13
14
15 #include "mothur.h"
16 #include "mothurout.h"
17 #include "command.hpp"
18
19 /***********************************************************************/
20
21 class OptionParser {
22 public:
23         OptionParser(string);
24         ~OptionParser() {}
25         map<string, string> getParameters();
26         bool getNameFile(vector<string>);
27 private:
28         map<string, string> parameters;
29         MothurOut* m;
30 };
31
32 /***********************************************************************/
33
34 #endif