logsd.h

   1 #ifndef LOGSD_H
   2 #define LOGSD_H
   3
   4 /*
   5  *  logsd.h
   6  *  Mothur
   7  *
   8  *  Created by Thomas Ryabin on 2/23/09.
   9  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
  10  *
  11  */
  12 #include "calculator.h"
  13
  14 /*This class implements the LogSD estimator on single group.
  15 It is a child of the calculator class.*/
  16
  17 /***********************************************************************/
  18
  19 class LogSD : public Calculator  {
  20
  21 public:
  22         LogSD() : Calculator("logseries", 3) {};
  23         EstOutput getValues(SAbundVector*);
  24         EstOutput getValues(SharedRAbundVector*, SharedRAbundVector*) { return data; };
  25
  26 private:
  27         double logS(double);
  28         RAbundVector rdata;
  29 };
  30
  31 /***********************************************************************/
  32
  33 #endif
  34
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  37
  38