getgroupcommand.h

   1 #ifndef GETGROUPCOMMAND_H
   2 #define GETGROUPCOMMAND_H
   3
   4 /*
   5  *  getgroupcommand.h
   6  *  Mothur
   7  *
   8  *  Created by Thomas Ryabin on 2/2/09.
   9  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
  10  *
  11  */
  12
  13 #include "command.hpp"
  14 #include "globaldata.hpp"
  15
  16 class GetgroupCommand : public Command {
  17 public:
  18         GetgroupCommand(string);
  19         ~GetgroupCommand();
  20         int execute();
  21         void help();
  22
  23 private:
  24         GlobalData* globaldata;
  25         GroupMap* groupMap;
  26         string outputFile, sharedfile;
  27         ofstream out;
  28         ifstream in;
  29         bool abort;
  30
  31 };
  32
  33 #endif