geom.h

   1 #ifndef GEOM_H
   2 #define GEOM_H
   3
   4 /*
   5  *  geom.h
   6  *  Mothur
   7  *
   8  *  Created by Thomas Ryabin on 2/23/09.
   9  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
  10  *
  11  */
  12 #include "calculator.h"
  13
  14 /* This class implements the geometric estimator on single group.
  15 It is a child of the calculator class. */
  16
  17 /***********************************************************************/
  18
  19 class Geom : public Calculator  {
  20
  21 public:
  22         Geom() : Calculator("geometric", 3) {};
  23         EstOutput getValues(SAbundVector*);
  24         EstOutput getValues(SharedRAbundVector*, SharedRAbundVector*) {return data;};
  25
  26 private:
  27         double kEq(double, double);
  28         RAbundVector getRAbundVector(SAbundVector*);
  29         RAbundVector rdata;
  30 };
  31
  32 /***********************************************************************/
  33
  34 #endif
  35
  36
  37
  38
  39