fullmatrix.cpp

   1 /*
   2  *  fullmatrix.cpp
   3  *  Mothur
   4  *
   5  *  Created by Sarah Westcott on 3/6/09.
   6  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
   7  *
   8  */
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  10 #include "fullmatrix.h"
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  13 /**************************************************************************/
  14 //This constructor reads a distance matrix file and stores the data in the matrix.
  15 FullMatrix::FullMatrix(ifstream& f) {
  16         try{
  17                 string name;
  18                 f >> numSeqs >> name;
  19
  20                 matrix.resize(numSeqs);
  21
  22
  23
  24         }
  25         catch(exception& e) {
  26                 cout << "Standard Error: " << e.what() << " has occurred in the FullMatrix class Function FullMatrix. Please contact Pat Schloss at pschloss@microbio.umass.edu." << "\n";
  27                 exit(1);
  28         }
  29         catch(...) {
  30                 cout << "An unknown error has occurred in the FullMatrix class function FullMatrix. Please contact Pat Schloss at pschloss@microbio.umass.edu." << "\n";
  31                 exit(1);
  32         }
  33 }
  34 /**************************************************************************/
  35 int FullMatrix::getNumSeqs(){ return numSeqs; }
  36 /**************************************************************************/