5a659e551d6054b916e50d56643bc3acbd0d2872
[don.git] / resume / curriculum_vitae.mdwn
1 [[!meta title="Curriculum Vitæ"]]
2 Curriculum Vitæ
3 ===============
4
5 * [Don Armstrong](http://www.donarmstrong.com/)
6 * <don@donarmstrong.com>
7 * <http://www.donarmstrong.com>
8
9 Education
10 ----------
11 * Doctor of Philosophy
12   * 2001-2008 *Cell, Molecular and Developmental Biology*.
13    [University of California at Riverside](http://www.ucr.edu).
14    Dissertation: The Role of membrane Composition in the Activity of
15    Membrane-Associated Signal Transduction Proteins.
16 * Bachelor of Science
17   * 1997-2001 [Biology](http://bio.ucr.edu).
18     [University of California at Riverside](http://www.ucr.edu).
19     
20 Postdoctoral Experience
21 -------------------------
22
23 ### University of Southern California ###
24
25 * 2013--Present. Postdoctoral researcher under Chaim O. Jacob.
26   Identifying genes and causal alleles associated with Systemic Lupus
27   Erythematosus using genome-wide association, next-generation
28   sequencing, computational and biochemical approaches.
29 * 2009--2010. Postdoctoral researcher under Florence M. Hofman.
30   Identifying signaling pathways which are responsible for the
31   functional alteration of endothelial cells in glioblastoma
32   multiforme and arteriovenous malformations.
33
34 ### University of California at Riverside ###
35 * 2010--2012. Postdoctoral researcher under Raphael Zidovetzki.
36   Identifying genes which are associated with Systemic Lupus
37   Erythematosus using prior information and targeted trio-based
38   studies.
39
40 Teaching
41 --------
42 ### Teaching Assistant ###
43 * 2004--2007. University of California at Riverside. First and second
44   quarter introduction to biology for majors (BIO 5A and 5B).
45   Introduction to Genetics (BIO 102), Human Embryology (CBNS 169).
46
47 Work in Industry
48 ----------------
49 ### Non-Profit ###
50 * 2004--Present. [Debian Project](http://www.debian.org), Developer;
51   Technical Committee Member (2010--Present)
52
53 ### Employment Experience ###
54 * 2002-2003. *Socratech* in Rochester, NY. Bioinformatics researcher:
55   developed new microarray analysis methods for a start-up
56   biotechnology company working on developing treatments for
57   Alzheimer's disease
58
59 Publications
60 ------------
61 ### In Preparation ###
62 1. *Don L. Armstrong*, Raphael Zidovetzki, and Chaim O Jacob. Novel
63   lupus associated genes discovered in GWAS; two signals explain all
64   HLA SNPs in European Americans. /In preparation/.
65
66 ## Refereed Publications ##
67 1. Chaim O Jacob, Miriam Eisenstein, Mary C Dinauer, Wenyu Ming,
68    Qiang Liu, Sutha John, Francesco P Quismorio, Andreas Reiff, Barry
69    L Myones, Kenneth M Kaufman, Deborah McCurdy, John B Harley, Earl
70    Silverman, Robert P Kimberly, Timothy J Vyse, Patrick M Gaffney,
71    Kathy L Moser, Marisa Klein-Gitelman, Linda Wagner-Weiner, Carl D
72    Langefeld, *Don L Armstrong*, and Raphael Zidovetzki.
73    Lupus-associated causal mutation in neutrophil cytosolic factor 2
74    (NCF2) brings unique insights to the structure and function of
75    NADPH oxidase. /Proc Natl Acad Sci USA/, 109(2):59--67, Jan 2012.
76 2. *Don L Armstrong*, Omer Markovitch, Raphael Zidovetzki, and Doron
77    Lancet. Replication of simulated prebiotic amphiphile vesicles
78    controlled by experimental lipid physicochemical properties. /Phys
79    Biol/, 8(6):066001, Dec 2011.
80
81 3. Christopher J Stapleton, *Don L Armstrong*, Raphael Zidovetzki,
82    Charles Y Liu, Steven L Giannotta, and Florence M Hofman.
83    Thrombospondin-1 modulates the angiogenic phenotype of human
84    cerebral arteriovenous malformation endothelial cells.
85    /Neurosurgery/, 68(5):1342--53, May 2011.
86
87 4. *D L Armstrong*, A Reiff, B L Myones, F P Quismorio, M
88    Klein-Gitelman, D McCurdy, L Wagner-Weiner, E Silverman, J O
89    Ojwang, K M Kaufman, J A Kelly, J T Merrill, J B Harley, S-C Bae, T
90    J Vyse, G S Gilkeson, P M Gaffney, K L Moser, C Putterman, J C
91    Edberg, E E Brown, J Ziegler, C D Langefeld, R Zidovetzki, and C O
92    Jacob. Identification of new SLE-associated genes with a two-step
93    Bayesian study design. /Genes Immun/, 10(5):446--56, Jul 2009.
94
95 5.  Chaim O Jacob, Jiankun Zhu, *Don L Armstrong*, /et al./
96     Identification of IRAK1 as a risk gene with critical role in the
97     pathogenesis of systemic lupus erythematosus. /Proc Natl Acad Sci
98     USA/, 106(15):6256--61, Apr 2009.
99
100 6.  Bahram Namjou, Andrea L Sestak, *Don L Armstrong*, Raphael
101     Zidovetzki, /et al./ High-density genotyping of STAT4 reveals
102     multiple haplotypic associations with systemic lupus erythematosus
103     in different racial groups. /Arthritis Rheum/, 60(4):1085--95, Apr 2009.
104
105 7. *Don Armstrong* and Raphael Zidovetzki. Amplification of
106    diacylglycerol activation of protein kinase c by cholesterol.
107    /Biophys J/, 94(12):4700--10, Jun 2008.
108
109 8. *Don L Armstrong*, Chaim O Jacob, and Raphael Zidovetzki.
110    Function2gene: a gene selection tool to increase the power of
111    genetic association studies by utilizing public databases and
112    expert knowledge. *BMC Bioinformatics*, 9:311, 2008.
113
114 9.  Chaim O Jacob, Andreas Reiff, *Don L Armstrong*, Barry L Myones,
115     Earl Silverman, Marisa Klein-Gitelman, Deborah McCurdy, Linda
116     Wagner-Weiner, James J Nocton, Aaron Solomon, and Raphael
117     Zidovetzki. Identification of novel susceptibility genes in
118     childhood-onset systemic lupus erythematosus using a uniquely
119     designed candidate gene pathway platform. /Arthritis Rheum/,
120     56(12):4164--73, Dec 2007.
121
122 10. Raphael Zidovetzki, Burkhard Rost, /Don L Armstrong/, and Israel
123     Pecht. Transmembrane domains in the functions of fc receptors.
124     /Biophys Chem/, 100(1-3):555--75, 2003.
125
126 11. *Don L Armstrong*, Dan B Borchardt, and Raphael Zidovetzki.
127     Synergistic perturbation of phosphatidylcholine/sphingomyelin
128     bilayers by diacylglycerol and cholesterol. /Biochem Biophys Res
129     Commun/, 296(4):806--12, Aug 2002.
130
131 12. Zhenhua Wu, Huang Guo, Nienwen Chow, Jan Sallstrom, Robert D Bell, Rashid
132   Deane, Andrew I Brooks, Suhasini Kanagala, Anna Rubio, Abhay Sagare, Dong
133   Liu, Fang Li, *Don Armstrong*, Thomas Gasiewicz, Raphael Zidovetzki, Xiaomei
134   Song, Florence Hofman, and Berislav V Zlokovic. Role of the meox2 homeobox gene in neurovascular dysfunction in
135   alzheimer disease. /Nat Med/, 11(9):959--65, Sep 2005.
136
137 13. Rashid Deane, Shi Du Yan, Ram Kumar Submamaryan, Barbara LaRue,
138     Suzana Jovanovic, Elizabeth Hogg, Deborah Welch, Lawrence Manness,
139     Chang Lin, Jin Yu, Hong Zhu, Jorge Ghiso, Blas Frangione, Alan
140     Stern, Ann Marie Schmidt, \textbf{Don L Armstrong}, Bernd Arnold,
141     Birgit Liliensiek, Peter Nawroth, Florence Hofman, Mark Kindy,
142     David Stern, and Berislav Zlokovic. Rage mediates amyloid-beta
143     peptide transport across the blood-brain barrier and accumulation
144     in brain. /Nat Med/, 9(7):907--13, Jul 2003.
145
146 Selected Presentations
147 ----------------------
148 ### Conference Presentations ###
149 * 2007-06-07. FOCIS 2007. Uniquely designed candidate gene
150   identification platform discovers novel genes in childhood-onset
151   SLE.
152
153 References
154 ----------
155 Please e-mail <don@donarmstrong.com> for references
156