-CREATE TABLE [Allele] (
- [allele_id] [int] NOT NULL ,
- [allele] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [rev_allele_id] [int] NULL ,
- [src] [varchar] (10) NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
+CREATE TABLE [Allele]
+(
+[allele_id] [int] NOT NULL ,
+[allele] [varchar](255) NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
+[rev_allele_id] [int] NULL ,
+[src] [varchar](10) NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [AlleleFlagCode]
+(
+[code] [tinyint] NOT NULL ,
+[abbrev] [varchar](12) NOT NULL ,
+[descrip] [varchar](255) NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [AlleleMotif]
+(
+[allele_id] [int] NOT NULL ,
+[motif_order] [int] NOT NULL ,
+[motif_id] [int] NOT NULL ,
+[repeat_cnt] [real] NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [AllocIds]
+(
+[name] [varchar](30) NOT NULL ,
+[id] [int] NOT NULL ,
+[cycle] [int] NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NULL ,
+[comment] [varchar](255) NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [Author]
+(
+[pub_id] [int] NOT NULL ,
+[position] [tinyint] NOT NULL ,
+[author] [varchar](255) NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [Batch_tax_id]
+(
+[batch_id] [int] NOT NULL ,
+[tax_id] [int] NOT NULL ,
+[update_time] [datetime] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [ChiSqPValueLookUp]
+(
+[df] [tinyint] NOT NULL ,
+[chisq_from] [float] NOT NULL ,
+[chisq_to] [float] NOT NULL ,
+[pvalue_upper_bound] [float] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [CpGCode]
+(
+[code] [tinyint] NOT NULL ,
+[abbrev] [varchar](12) NOT NULL ,
+[descrip] [varchar](255) NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [GenBankDivisionCode]
+(
+[code] [varchar](6) NOT NULL ,
+[abbrev] [varchar](40) NOT NULL ,
+[descrip] [varchar](255) NOT NULL ,
+[display_order] [tinyint] NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [GenderCode]
+(
+[code] [char](1) NOT NULL ,
+[gender] [varchar](6) NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [GenomeBuildInfo]
+(
+[snp_build_id] [int] NOT NULL ,
+[tax_id] [int] NOT NULL ,
+[database_name] [varchar](32) NOT NULL ,
+[ncbi_build_id] [int] NOT NULL ,
+[ncbi_build_ver] [tinyint] NOT NULL ,
+[insert_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
+[is_major] [tinyint] NOT NULL ,
+[ncbi_genome_tax_id] [int] NOT NULL ,
+[ref_assembly] [varchar](32) NULL ,
+[annot_set_acc] [varchar](32) NULL ,
+[annot_set_ver] [smallint] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [GtyAllele]
+(
+[gty_id] [int] NOT NULL ,
+[rev_flag] [bit] NOT NULL ,
+[chr_num] [tinyint] NOT NULL ,
+[fwd_allele_id] [int] NOT NULL ,
+[unigty_id] [int] NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [IUPACna]
+(
+[allele] [varchar](1) NOT NULL ,
+[meaning] [varchar](10) NOT NULL ,
+[bitcode] [varchar](4) NOT NULL ,
+[value] [tinyint] NOT NULL ,
+[rev_base] [char](1) NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [LoadHistory]
+(
+[build_id] [int] NOT NULL ,
+[loaddate] [smalldatetime] NOT NULL ,
+[status] [char](30) NOT NULL ,
+[comments] [varchar](255) NULL ,
+[script] [varchar](255) NULL ,
+[ftp_done_date] [smalldatetime] NULL ,
+[entrez_done_date] [smalldatetime] NULL ,
+[blastdb_done_date] [smalldatetime] NULL ,
+[web_date] [smalldatetime] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [LocTypeCode]
+(
+[code] [tinyint] NOT NULL ,
+[abbrev] [varchar](12) NOT NULL ,
+[descrip] [varchar](255) NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [MapLinkCode]
+(
+[which_code] [varchar](20) NOT NULL ,
+[code] [tinyint] NOT NULL ,
+[abbr] [varchar](10) NULL ,
+[note] [varchar](255) NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [Method]
+(
+[method_id] [int] NOT NULL ,
+[handle] [varchar](20) NOT NULL ,
+[loc_method_id] [varchar](64) NOT NULL ,
+[loc_method_id_upp] [varchar](64) NOT NULL ,
+[method_class] [tinyint] NULL ,
+[template_type] [tinyint] NULL ,
+[seq_both_strands] [varchar](3) NULL ,
+[mult_pcr_amplification] [varchar](3) NULL ,
+[mult_clones_tested] [varchar](3) NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [MethodClass]
+(
+[meth_class_id] [tinyint] NOT NULL ,
+[name] [varchar](64) NOT NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
+[validation_status] [tinyint] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [MethodLine]
+(
+[method_id] [int] NOT NULL ,
+[line_num] [tinyint] NOT NULL ,
+[line] [varchar](255) NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [Moltype]
+(
+[code] [tinyint] NOT NULL ,
+[moltype] [varchar](10) NOT NULL ,
+[descrip] [varchar](255) NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [Motif]
+(
+[motif_id] [int] NOT NULL ,
+[motif] [varchar](253) NOT NULL ,
+[rev_motif_id] [int] NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [ObsGenotype]
+(
+[gty_id] [int] NOT NULL ,
+[obs] [varchar](512) NOT NULL ,
+[obs_upp_fix] [varchar](512) NOT NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [ObsVariation]
+(
+[var_id] [int] NOT NULL ,
+[pattern] [varchar](255) NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NULL ,
+[univar_id] [int] NULL ,
+[var_flag] [tinyint] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [OrgDbStatus]
+(
+[database_name] [varchar](32) NOT NULL ,
+[SNP_cnt] [int] NULL ,
+[SubSNP_cnt] [int] NULL ,
+[cluster_cnt] [int] NULL ,
+[unmapped_rs_cnt] [int] NULL ,
+[SubInd_cnt] [int] NULL ,
+[ind_cnt] [int] NULL ,
+[SubInd_ss_cnt] [int] NULL ,
+[SubPop_cnt] [int] NULL ,
+[pop_cnt] [int] NULL ,
+[SubPop_ss_cnt] [int] NULL ,
+[GtyFreqBySsPop_ss_cnt] [int] NULL ,
+[AlleleFreqBySsPop_ss_cnt] [int] NULL ,
+[SNPGtyFreq_rs_cnt] [int] NULL ,
+[SNPAlleleFreq_rs_cnt] [int] NULL ,
+[snp_build_max] [int] NULL ,
+[genome_build_max] [varchar](8) NULL ,
+[map_time] [smalldatetime] NULL ,
+[cluster_time_max] [smalldatetime] NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NULL ,
+[last_SNPBatch_time] [smalldatetime] NULL ,
+[last_POPBatch_time] [smalldatetime] NULL ,
+[last_INDBatch_time] [smalldatetime] NULL ,
+[rsMax] [int] NULL ,
+[rsMissenseMax] [int] NULL ,
+[copy2FTP_time] [smalldatetime] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [OrganismTax]
+(
+[organism] [varchar](128) NOT NULL ,
+[tax_id] [int] NOT NULL ,
+[common_name] [varchar](32) NULL ,
+[gpipe_abbr] [varchar](7) NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
+[comment] [varchar](255) NULL ,
+[division_cd] [varchar](6) NULL ,
+[database_name] [varchar](32) NOT NULL ,
+[short_common_name] [varchar](32) NOT NULL ,
+[tax_id_rank] [varchar](5) NOT NULL ,
+[species_tax_id] [int] NOT NULL ,
+[no_freq_summary] [bit] NULL ,
+[entrez_index] [smallint] NULL ,
+[pub_genome_build] [decimal] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [PopClass]
+(
+[pop_id] [int] NOT NULL ,
+[pop_class_id] [int] NOT NULL ,
+[snp_count] [int] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [PopClassCode]
+(
+[pop_class_id] [int] NOT NULL ,
+[pop_class] [char](50) NOT NULL ,
+[pop_class_text] [char](255) NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [Publication]
+(
+[pub_id] [int] NOT NULL ,
+[pmid] [int] NULL ,
+[handle] [varchar](20) NOT NULL ,
+[meduid] [int] NULL ,
+[title] [varchar](235) NOT NULL ,
+[journal] [varchar](255) NULL ,
+[vol] [varchar](255) NULL ,
+[suppl] [varchar](128) NULL ,
+[issue] [varchar](128) NULL ,
+[i_suppl] [varchar](128) NULL ,
+[pages] [varchar](255) NULL ,
+[year] [smallint] NOT NULL ,
+[status] [tinyint] NOT NULL ,
+[blobflag] [tinyint] NULL ,
+[last_updated] [smalldatetime] NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [SNPGlossary]
+(
+[term] [varchar](256) NOT NULL ,
+[description] [varchar](4000) NULL ,
+[last_updated] [smalldatetime] NULL ,
+[used_in] [varchar](32) NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [SNP_tax_id]
+(
+[snp_id] [int] NOT NULL ,
+[tax_id] [int] NULL ,
+[update_time] [smalldatetime] NULL ,
+[status] [char](1) NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [SnpChrCode]
+(
+[code] [varchar](8) NOT NULL ,
+[abbrev] [varchar](20) NOT NULL ,
+[descrip] [varchar](255) NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
+[sort_order] [tinyint] NULL ,
+[db_name] [varchar](32) NULL ,
+[NC_acc] [varchar](16) NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [SnpClassCode]
+(
+[code] [tinyint] NOT NULL ,
+[abbrev] [varchar](20) NOT NULL ,
+[descrip] [varchar](255) NOT NULL ,
+[display_str] [varchar](255) NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [SnpFunctionCode]
+(
+[code] [tinyint] NOT NULL ,
+[abbrev] [varchar](20) NOT NULL ,
+[descrip] [varchar](255) NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
+[top_level_class] [char](5) NOT NULL ,
+[is_coding] [tinyint] NOT NULL ,
+[is_exon] [bit] NULL ,
+[var_prop_loc_code] [int] NULL ,
+[var_prop_effect_code] [int] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [SnpValidationCode]
+(
+[code] [tinyint] NOT NULL ,
+[abbrev] [varchar](64) NOT NULL ,
+[descrip] [varchar](255) NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [StrandCode]
+(
+[code] [tinyint] NOT NULL ,
+[abbrev] [varchar](20) NOT NULL ,
+[rs_to_ss_orien] [bit] NOT NULL ,
+[descrip] [varchar](255) NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [SubSNPDelComm]
+(
+[comment_id] [smallint] NOT NULL ,
+[comment] [varchar](255) NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [SubSNPSeqTypeCode]
+(
+[code] [tinyint] NOT NULL ,
+[abbrev] [varchar](20) NOT NULL ,
+[descrip] [varchar](255) NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [Submitter]
+(
+[handle] [varchar](20) NOT NULL ,
+[name] [varchar](255) NOT NULL ,
+[fax] [varchar](255) NULL ,
+[phone] [varchar](255) NULL ,
+[email] [varchar](255) NULL ,
+[lab] [varchar](255) NULL ,
+[institution] [varchar](255) NULL ,
+[address] [varchar](255) NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [TemplateType]
+(
+[temp_type_id] [tinyint] NOT NULL ,
+[name] [varchar](64) NOT NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [UniGty]
+(
+[unigty_id] [int] NOT NULL ,
+[gty_str] [varchar](255) NULL ,
+[allele_id_1] [int] NOT NULL ,
+[allele_id_2] [int] NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [UniVariAllele]
+(
+[univar_id] [int] NOT NULL ,
+[allele_id] [int] NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [UniVariation]
+(
+[univar_id] [int] NOT NULL ,
+[var_str] [varchar](900) NULL ,
+[allele_cnt] [smallint] NOT NULL ,
+[subsnp_class] [tinyint] NOT NULL ,
+[iupack_code] [char](1) NOT NULL ,
+[top_or_bot_strand] [char](1) NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
+[src_code] [tinyint] NULL ,
+[rev_univar_id] [int] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [UniVariationSrcCode]
+(
+[code] [tinyint] NOT NULL ,
+[abbrev] [varchar](20) NOT NULL ,
+[descrip] [varchar](255) NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [VariAllele]
+(
+[var_id] [int] NOT NULL ,
+[allele_id] [int] NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [db_ftp_table_list]
+(
+[table_name] [varchar](32) NOT NULL ,
+[db_str] [varchar](64) NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [db_map_table_name]
+(
+[table_name] [varchar](32) NOT NULL ,
+[to_index] [bit] NULL ,
+[isCurrent] [char](1) NULL ,
+[inNonHuman] [char](1) NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [dn_Allele_rev]
+(
+[allele_id] [int] NOT NULL ,
+[rev_flag] [tinyint] NOT NULL ,
+[fwd_allele_id] [int] NOT NULL ,
+[fwd_allele] [varchar](255) NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [dn_Motif_rev]
+(
+[motif_id] [int] NOT NULL ,
+[rev_flag] [tinyint] NOT NULL ,
+[fwd_motif] [varchar](253) NULL ,
+[fwd_motif_id] [int] NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [dn_UniGty_allele]
+(
+[unigty_id] [int] NOT NULL ,
+[chr_num] [tinyint] NOT NULL ,
+[allele_id] [int] NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [dn_UniGty_rev]
+(
+[unigty_id] [int] NOT NULL ,
+[rev_flag] [tinyint] NOT NULL ,
+[fwd_unigty_id] [int] NOT NULL ,
+[fwd_gty_str] [varchar](255) NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [dn_UniVariation_rev]
+(
+[univar_id] [int] NOT NULL ,
+[rev_flag] [tinyint] NOT NULL ,
+[fwd_univar_id] [int] NULL ,
+[fwd_univar_str] [varchar](900) NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [dn_baseFlip]
+(
+[base] [char](1) NULL ,
+[rev_flag] [tinyint] NULL ,
+[fwd_base] [char](1) NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [dn_gty2unigty_trueSNP]
+(
+[gty_id] [int] NOT NULL ,
+[rev_flag] [bit] NOT NULL ,
+[unigty_id] [int] NULL ,
+[obs] [varchar](512) NOT NULL ,
+[gty_str] [varchar](255) NULL
+)\r
+GO
+
+CREATE TABLE [dn_summary]
+(
+[tax_id] [int] NOT NULL ,
+[build_id] [int] NOT NULL ,
+[type] [varchar](20) NOT NULL ,
+[cnt] [int] NOT NULL ,
+[create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
+[last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL
+)\r
GO
-
-CREATE TABLE [AlleleFlagCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (12) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [AlleleMotif] (
- [allele_id] [int] NOT NULL ,
- [motif_order] [int] NOT NULL ,
- [motif_id] [int] NOT NULL ,
- [repeat_cnt] [real] NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [AllocIds] (
- [name] [varchar] (30) NOT NULL ,
- [id] [int] NOT NULL ,
- [cycle] [int] NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [Author] (
- [pub_id] [int] NOT NULL ,
- [position] [tinyint] NOT NULL ,
- [author] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [Batch_tax_id] (
- [batch_id] [int] NOT NULL ,
- [tax_id] [int] NOT NULL ,
- [update_time] [datetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [ChiSqPValueLookUp] (
- [df] [tinyint] NOT NULL ,
- [chisq_from] [float] NOT NULL ,
- [chisq_to] [float] NOT NULL ,
- [pvalue_upper_bound] [float] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [CpGCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (12) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [GenBankDivisionCode] (
- [code] [varchar] (6) NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (40) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [display_order] [tinyint] NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [GenderCode] (
- [code] [char] (1) NOT NULL ,
- [gender] [varchar] (6) NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [GenomeBuildInfo] (
- [snp_build_id] [int] NOT NULL ,
- [tax_id] [int] NOT NULL ,
- [database_name] [varchar] (32) NOT NULL ,
- [ncbi_build_id] [int] NOT NULL ,
- [ncbi_build_ver] [tinyint] NOT NULL ,
- [insert_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [is_major] [tinyint] NOT NULL ,
- [ncbi_genome_tax_id] [int] NOT NULL ,
- [ref_assembly] [varchar] (255) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [GtyAllele] (
- [gty_id] [int] NOT NULL ,
- [rev_flag] [bit] NOT NULL ,
- [chr_num] [tinyint] NOT NULL ,
- [fwd_allele_id] [int] NOT NULL ,
- [unigty_id] [int] NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [IUPACna] (
- [allele] [varchar] (1) NOT NULL ,
- [meaning] [varchar] (10) NOT NULL ,
- [bitcode] [varchar] (4) NOT NULL ,
- [value] [tinyint] NOT NULL ,
- [rev_base] [char] (1) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [LoadHistory] (
- [build_id] [int] NOT NULL ,
- [loaddate] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [status] [char] (30) NOT NULL ,
- [comments] [varchar] (255) NULL ,
- [script] [varchar] (255) NULL ,
- [ftp_done_date] [smalldatetime] NULL ,
- [entrez_done_date] [smalldatetime] NULL ,
- [blastdb_done_date] [smalldatetime] NULL ,
- [web_date] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [LocTypeCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (12) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [MapLinkCode] (
- [which_code] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbr] [varchar] (10) NULL ,
- [note] [varchar] (255) NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [Method] (
- [method_id] [int] NOT NULL ,
- [handle] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [loc_method_id] [varchar] (64) NOT NULL ,
- [loc_method_id_upp] [varchar] (64) NOT NULL ,
- [method_class] [tinyint] NULL ,
- [template_type] [tinyint] NULL ,
- [seq_both_strands] [varchar] (3) NULL ,
- [mult_pcr_amplification] [varchar] (3) NULL ,
- [mult_clones_tested] [varchar] (3) NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [MethodClass] (
- [meth_class_id] [tinyint] NOT NULL ,
- [name] [varchar] (64) NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [validation_status] [tinyint] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [MethodLine] (
- [method_id] [int] NOT NULL ,
- [line_num] [tinyint] NOT NULL ,
- [line] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [Moltype] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [moltype] [varchar] (10) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [Motif] (
- [motif_id] [int] NOT NULL ,
- [motif] [varchar] (253) NOT NULL ,
- [rev_motif_id] [int] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [ObsGenotype] (
- [gty_id] [int] NOT NULL ,
- [obs] [varchar] (512) NOT NULL ,
- [obs_upp_fix] [varchar] (512) NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [ObsVariation] (
- [var_id] [int] NOT NULL ,
- [pattern] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL ,
- [univar_id] [int] NULL ,
- [var_flag] [tinyint] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [OrgDbStatus] (
- [database_name] [varchar] (32) NOT NULL ,
- [SNP_cnt] [int] NULL ,
- [SubSNP_cnt] [int] NULL ,
- [cluster_cnt] [int] NULL ,
- [unmapped_rs_cnt] [int] NULL ,
- [SubInd_cnt] [int] NULL ,
- [ind_cnt] [int] NULL ,
- [SubInd_ss_cnt] [int] NULL ,
- [SubPop_cnt] [int] NULL ,
- [pop_cnt] [int] NULL ,
- [SubPop_ss_cnt] [int] NULL ,
- [GtyFreqBySsPop_ss_cnt] [int] NULL ,
- [AlleleFreqBySsPop_ss_cnt] [int] NULL ,
- [SNPGtyFreq_rs_cnt] [int] NULL ,
- [SNPAlleleFreq_rs_cnt] [int] NULL ,
- [snp_build_max] [int] NULL ,
- [genome_build_max] [varchar] (8) NULL ,
- [map_time] [smalldatetime] NULL ,
- [cluster_time_max] [smalldatetime] NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_SNPBatch_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_POPBatch_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_INDBatch_time] [smalldatetime] NULL ,
- [rsMax] [int] NULL ,
- [rsMissenseMax] [int] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [OrganismTax] (
- [organism] [varchar] (40) NOT NULL ,
- [tax_id] [int] NOT NULL ,
- [common_name] [varchar] (32) NULL ,
- [gpipe_abbr] [varchar] (7) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [comment] [varchar] (255) NULL ,
- [division_cd] [varchar] (6) NULL ,
- [database_name] [varchar] (32) NOT NULL ,
- [short_common_name] [varchar] (32) NOT NULL ,
- [tax_id_rank] [varchar] (5) NOT NULL ,
- [species_tax_id] [int] NOT NULL ,
- [no_freq_summary] [bit] NULL ,
- [entrez_index] [smallint] NULL ,
- [pub_genome_build] [decimal](4, 1) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [PopClass] (
- [pop_id] [int] NOT NULL ,
- [pop_class_id] [int] NOT NULL ,
- [snp_count] [int] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [PopClassCode] (
- [pop_class_id] [int] NOT NULL ,
- [pop_class] [char] (50) NOT NULL ,
- [pop_class_text] [char] (255) NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [Publication] (
- [pub_id] [int] NOT NULL ,
- [pmid] [int] NULL ,
- [handle] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [meduid] [int] NULL ,
- [title] [varchar] (235) NOT NULL ,
- [journal] [varchar] (255) NULL ,
- [vol] [varchar] (255) NULL ,
- [suppl] [varchar] (128) NULL ,
- [issue] [varchar] (128) NULL ,
- [i_suppl] [varchar] (128) NULL ,
- [pages] [varchar] (255) NULL ,
- [year] [smallint] NOT NULL ,
- [status] [tinyint] NOT NULL ,
- [blobflag] [tinyint] NULL ,
- [last_updated] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SNPGlossary] (
- [term] [varchar] (256) NOT NULL ,
- [description] [varchar] (4000) NULL ,
- [last_updated] [smalldatetime] NULL ,
- [used_in] [varchar] (32) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SNP_tax_id] (
- [snp_id] [int] NOT NULL ,
- [tax_id] [int] NULL ,
- [update_time] [smalldatetime] NULL ,
- [status] [char] (1) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SnpChrCode] (
- [code] [varchar] (8) NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [sort_order] [tinyint] NULL ,
- [db_name] [varchar] (32) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SnpClassCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [display_str] [varchar] (255) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SnpFunctionCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [top_level_class] [char] (5) NOT NULL ,
- [is_coding] [tinyint] NOT NULL ,
- [is_exon] [bit] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SnpValidationCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (40) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [StrandCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [rs_to_ss_orien] [bit] NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SubSNPDelComm] (
- [comment_id] [smallint] NOT NULL ,
- [comment] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SubSNPSeqTypeCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [Submitter] (
- [handle] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [name] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [fax] [varchar] (255) NULL ,
- [phone] [varchar] (255) NULL ,
- [email] [varchar] (255) NULL ,
- [lab] [varchar] (255) NULL ,
- [institution] [varchar] (255) NULL ,
- [address] [varchar] (255) NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [TemplateType] (
- [temp_type_id] [tinyint] NOT NULL ,
- [name] [varchar] (64) NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [UniGty] (
- [unigty_id] [int] NOT NULL ,
- [gty_str] [varchar] (255) NULL ,
- [allele_id_1] [int] NOT NULL ,
- [allele_id_2] [int] NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [UniVariAllele] (
- [univar_id] [int] NOT NULL ,
- [allele_id] [int] NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [UniVariation] (
- [univar_id] [int] NOT NULL ,
- [var_str] [varchar] (900) NULL ,
- [allele_cnt] [smallint] NOT NULL ,
- [subsnp_class] [tinyint] NOT NULL ,
- [iupack_code] [char] (1) NOT NULL ,
- [top_or_bot_strand] [char] (1) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [src_code] [tinyint] NULL ,
- [rev_univar_id] [int] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [UniVariationSrcCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [VariAllele] (
- [var_id] [int] NOT NULL ,
- [allele_id] [int] NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [db_DataDictionaryNew] (
- [tab] [varchar] (64) NULL ,
- [col] [varchar] (32) NULL ,
- [col_order] [int] NULL ,
- [typ] [varchar] (16) NULL ,
- [length] [int] NULL ,
- [description] [varchar] (6000) NULL ,
- [todo] [varchar] (1000) NULL ,
- [update_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [db_ftp_table_list] (
- [table_name] [varchar] (32) NOT NULL ,
- [db_str] [varchar] (64) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [db_map_table_name] (
- [table_name] [varchar] (32) NOT NULL ,
- [to_index] [bit] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_Allele_rev] (
- [allele_id] [int] NOT NULL ,
- [rev_flag] [tinyint] NOT NULL ,
- [fwd_allele_id] [int] NOT NULL ,
- [fwd_allele] [varchar] (255) NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_Motif_rev] (
- [motif_id] [int] NOT NULL ,
- [rev_flag] [tinyint] NOT NULL ,
- [fwd_motif] [varchar] (253) NULL ,
- [fwd_motif_id] [int] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_UniGty_allele] (
- [unigty_id] [int] NOT NULL ,
- [chr_num] [tinyint] NOT NULL ,
- [allele_id] [int] NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_UniGty_rev] (
- [unigty_id] [int] NOT NULL ,
- [rev_flag] [tinyint] NOT NULL ,
- [fwd_unigty_id] [int] NOT NULL ,
- [fwd_gty_str] [varchar] (255) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_UniVariation_rev] (
- [univar_id] [int] NOT NULL ,
- [rev_flag] [tinyint] NOT NULL ,
- [fwd_univar_id] [int] NULL ,
- [fwd_univar_str] [varchar] (900) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_baseFlip] (
- [base] [char] (1) NULL ,
- [rev_flag] [tinyint] NULL ,
- [fwd_base] [char] (1) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_gty2unigty_trueSNP] (
- [gty_id] [int] NOT NULL ,
- [rev_flag] [bit] NOT NULL ,
- [unigty_id] [int] NULL ,
- [obs] [varchar] (512) NOT NULL ,
- [gty_str] [varchar] (255) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_summary] (
- [tax_id] [int] NOT NULL ,
- [build_id] [int] NOT NULL ,
- [type] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [cnt] [int] NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
projects / dbsnp.git / blobdiff