]> git.donarmstrong.com Git - dbsnp.git/blobdiff - schema/shared_schema/dbSNP_main_constraint_postgresql.sql
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[dbsnp.git] / schema / shared_schema / dbSNP_main_constraint_postgresql.sql
index b5ee5d23fc65e6c4afc0add8c0908c20412b5e16..66edbcf0386c913ca3d3afe6ab0814610cba7ddc 100644 (file)
-ALTER TABLE "Allele" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_Allele" PRIMARY KEY   
-       (
-               "allele_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "AlleleFlagCode" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_AlleleFlagCode" PRIMARY KEY   
-       (
-               "code"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "AlleleMotif" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_AlleleMotif" PRIMARY KEY   
-       (
-               "allele_id",
-               "motif_order"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "AllocIds" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_AllocIds" PRIMARY KEY   
-       (
-               "name"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "Author" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_Author" PRIMARY KEY   
-       (
-               "pub_id",
-               "position"
-       )
-;
-
-
-
-ALTER TABLE "CpGCode" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_CpGCode" PRIMARY KEY   
-       (
-               "code"
-       )
-;
-
-
-
-ALTER TABLE "GenomeBuildInfo" ADD 
-       CONSTRAINT "DF__GenomeBui__inser__15E52B55" DEFAULT (getdate()) FOR "insert_time",
-       CONSTRAINT "DF__GenomeBui__is_ma__18C19800" DEFAULT (1) FOR "is_major",
-       CONSTRAINT "DF__GenomeBui__ncbi___23FE4082" DEFAULT (0) FOR "ncbi_genome_tax_id"
-;
-
-ALTER TABLE "GtyAllele" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_GtyAllele" PRIMARY KEY   
-       (
-               "gty_id",
-               "rev_flag",
-               "chr_num"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "IUPACna" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_IUPACna" PRIMARY KEY   
-       (
-               "allele"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "LoadHistory" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_LoadHistory" PRIMARY KEY   
-       (
-               "build_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "LocTypeCode" ADD 
-       CONSTRAINT "DF__LocTypeCo__creat__75CD617E" DEFAULT (getdate()) FOR "create_time",
-       CONSTRAINT "pk_LocTypeCode" PRIMARY KEY   
-       (
-               "code"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "MapLinkCode" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_MapLinkCode" PRIMARY KEY   
-       (
-               "which_code",
-               "code"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "Method" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_Method_mid" PRIMARY KEY   
-       (
-               "method_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "MethodClass" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_MethodClass" PRIMARY KEY   
-       (
-               "meth_class_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "MethodLine" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_MethodLine" PRIMARY KEY   
-       (
-               "method_id",
-               "line_num"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "Moltype" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_Moltype" PRIMARY KEY   
-       (
-               "code"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "Motif" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_Motif" PRIMARY KEY   
-       (
-               "motif_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "ObsGenotype" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_ObsGenotype" PRIMARY KEY   
-       (
-               "gty_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "ObsVariation" ADD 
-       CONSTRAINT "DF__ObsVariat__creat__3BB5CE82" DEFAULT (getdate()) FOR "create_time",
-       CONSTRAINT "DF__ObsVariat__last___3CA9F2BB" DEFAULT (getdate()) FOR "last_updated_time",
-       CONSTRAINT "pk_ObsVariation" PRIMARY KEY   
-       (
-               "var_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "OrgDbStatus" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_org_db_status" PRIMARY KEY   
-       (
-               "database_name"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "OrganismTax" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_organism" PRIMARY KEY   
-       (
-               "tax_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "PopClass" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_PopClass" PRIMARY KEY   
-       (
-               "pop_id",
-               "pop_class_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "PopClassCode" ADD 
-       CONSTRAINT "PK__PopClassCode__270595B6" PRIMARY KEY   
-       (
-               "pop_class_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "Publication" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_Publication" PRIMARY KEY   
-       (
-               "pub_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "SNPGlossary" ADD 
-       CONSTRAINT "DF__SNPGlossa__last___4050666D" DEFAULT (getdate()) FOR "last_updated",
-       CONSTRAINT "pk_SNPGlossary" PRIMARY KEY   
-       (
-               "term"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "SNP_tax_id" ADD 
-       CONSTRAINT "DF__SNP_tax_i__statu__31583BA0" DEFAULT ('C') FOR "status",
-       CONSTRAINT "pk_SNP_tax_id" PRIMARY KEY   
-       (
-               "snp_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "SnpChrCode" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_SnpChrCode" PRIMARY KEY   
-       (
-               "code"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "SnpClassCode" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_SnpClassCode" PRIMARY KEY   
-       (
-               "code"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "SnpFunctionCode" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_SnpFunctionCode" PRIMARY KEY   
-       (
-               "code"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "SnpValidationCode" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_SnpValidationCode" PRIMARY KEY   
-       (
-               "code"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "StrandCode" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_StrandCode" PRIMARY KEY   
-       (
-               "code"
-       )
-;
-
-
-
-ALTER TABLE "Submitter" ADD 
-       CONSTRAINT "DF_Submitter_create_time" DEFAULT (getdate()) FOR "create_time",
-       CONSTRAINT "pk_Submitter" PRIMARY KEY   
-       (
-               "handle"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "TemplateType" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_TemplateType" PRIMARY KEY   
-       (
-               "temp_type_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "UniGty" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_UniGty" PRIMARY KEY   
-       (
-               "unigty_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "UniVariAllele" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_UniVariAllele" PRIMARY KEY   
-       (
-               "univar_id",
-               "allele_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "UniVariation" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_UniVariation" PRIMARY KEY   
-       (
-               "univar_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "UniVariationSrcCode" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_UniVariationSrcCode" PRIMARY KEY   
-       (
-               "code"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "VariAllele" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_VariAllele" PRIMARY KEY   
-       (
-               "var_id",
-               "allele_id"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "db_DataDictionaryNew" ADD 
-       CONSTRAINT "DF__db_DataDi__updat__5BB889C0" DEFAULT (getdate()) FOR "update_time"
-;
-
-ALTER TABLE "db_ftp_table_list" ADD 
-       CONSTRAINT "DF__db_ftp_ta__creat__27F9B9EF" DEFAULT (getdate()) FOR "create_time",
-       CONSTRAINT "pk_db_ftp_table_list" PRIMARY KEY   
-       (
-               "table_name"
-       )
-;
-
-
-ALTER TABLE "dn_Allele_rev" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_dn_Allele_rev" PRIMARY KEY   
-       (
-               "allele_id",
-               "rev_flag"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "dn_Motif_rev" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_dn_Motif_rev" PRIMARY KEY   
-       (
-               "motif_id",
-               "rev_flag"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "dn_UniGty_allele" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_dn_UniGty_allele" PRIMARY KEY   
-       (
-               "unigty_id",
-               "chr_num"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "dn_UniGty_rev" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_dn_Gty_rev" PRIMARY KEY   
-       (
-               "unigty_id",
-               "rev_flag"
-       )
-;
-
-ALTER TABLE "dn_UniVariation_rev" ADD 
-       CONSTRAINT "pk_dn_UniVariation_rev" PRIMARY KEY   
-       (
-               "univar_id",
-               "rev_flag"
-       )
-;
-
-
-
-ALTER TABLE "dn_summary" ADD 
-       CONSTRAINT "DF__dn_summar__creat__383A4359" DEFAULT (getdate()) FOR "create_time",
-       CONSTRAINT "DF__dn_summar__last___392E6792" DEFAULT (getdate()) FOR "last_updated_time",
-        PRIMARY KEY   
-       (
-               "tax_id",
-               "build_id",
-               "type"
-       )
-;
-
+ALTER TABLE Allele ADD CONSTRAINT pk_Allele  PRIMARY KEY   (allele_id ASC);
+ALTER TABLE AlleleFlagCode ADD CONSTRAINT pk_AlleleFlagCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
+ALTER TABLE AlleleMotif ADD CONSTRAINT pk_AlleleMotif  PRIMARY KEY   (allele_id ASC,motif_order ASC);
+ALTER TABLE AllocIds ADD CONSTRAINT pk_AllocIds  PRIMARY KEY   (name ASC);
+ALTER TABLE Author ADD CONSTRAINT pk_Author  PRIMARY KEY   (pub_id ASC,position ASC);
+
+
+ALTER TABLE CpGCode ADD CONSTRAINT pk_CpGCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
+
+
+ALTER TABLE GenomeBuildInfo ALTER COLUMN insert_time SET DEFAULT NOW();
+ALTER TABLE GenomeBuildInfo ALTER COLUMN is_major SET DEFAULT (1);
+ALTER TABLE GenomeBuildInfo ALTER COLUMN ncbi_genome_tax_id SET DEFAULT (0);
+
+ALTER TABLE GtyAllele ADD CONSTRAINT pk_GtyAllele  PRIMARY KEY   (gty_id ASC,rev_flag ASC,chr_num ASC);
+ALTER TABLE IUPACna ADD CONSTRAINT pk_IUPACna  PRIMARY KEY   (allele ASC);
+ALTER TABLE LoadHistory ADD CONSTRAINT pk_LoadHistory  PRIMARY KEY   (build_id ASC);
+ALTER TABLE LocTypeCode ALTER COLUMN create_time SET DEFAULT NOW();
+ALTER TABLE LocTypeCode ADD CONSTRAINT pk_LocTypeCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
+ALTER TABLE MapLinkCode ADD CONSTRAINT pk_MapLinkCode  PRIMARY KEY   (which_code ASC,code ASC);
+ALTER TABLE Method ADD CONSTRAINT pk_Method_mid  PRIMARY KEY   (method_id ASC);
+ALTER TABLE MethodClass ADD CONSTRAINT pk_MethodClass  PRIMARY KEY   (meth_class_id ASC);
+ALTER TABLE MethodLine ADD CONSTRAINT pk_MethodLine  PRIMARY KEY   (method_id ASC,line_num ASC);
+ALTER TABLE Moltype ADD CONSTRAINT pk_Moltype  PRIMARY KEY   (code ASC);
+ALTER TABLE Motif ADD CONSTRAINT pk_Motif  PRIMARY KEY   (motif_id ASC);
+ALTER TABLE ObsGenotype ADD CONSTRAINT pk_ObsGenotype  PRIMARY KEY   (gty_id ASC);
+ALTER TABLE ObsVariation ALTER COLUMN create_time SET DEFAULT NOW();
+ALTER TABLE ObsVariation ALTER COLUMN last_updated_time SET DEFAULT NOW();
+ALTER TABLE ObsVariation ADD CONSTRAINT pk_ObsVariation  PRIMARY KEY   (var_id ASC);
+ALTER TABLE OrgDbStatus ADD CONSTRAINT pk_org_db_status  PRIMARY KEY   (database_name ASC);
+ALTER TABLE OrganismTax ADD CONSTRAINT pk_organism  PRIMARY KEY   (tax_id ASC);
+ALTER TABLE PopClass ADD CONSTRAINT pk_PopClass  PRIMARY KEY   (pop_id ASC,pop_class_id ASC);
+ALTER TABLE PopClassCode ADD CONSTRAINT PK__PopClassCode__270595B6  PRIMARY KEY   (pop_class_id ASC);
+ALTER TABLE Publication ADD CONSTRAINT pk_Publication  PRIMARY KEY   (pub_id ASC);
+ALTER TABLE SNPGlossary ALTER COLUMN last_updated SET DEFAULT NOW();
+ALTER TABLE SNPGlossary ADD CONSTRAINT pk_SNPGlossary  PRIMARY KEY   (term ASC);
+ALTER TABLE SNP_tax_id ALTER COLUMN status SET DEFAULT 'C';
+ALTER TABLE SNP_tax_id ADD CONSTRAINT pk_SNP_tax_id  PRIMARY KEY   (snp_id ASC);
+ALTER TABLE SnpChrCode ADD CONSTRAINT pk_SnpChrCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
+ALTER TABLE SnpClassCode ADD CONSTRAINT pk_SnpClassCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
+ALTER TABLE SnpFunctionCode ADD CONSTRAINT pk_SnpFunctionCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
+ALTER TABLE SnpValidationCode ADD CONSTRAINT pk_SnpValidationCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
+ALTER TABLE StrandCode ADD CONSTRAINT pk_StrandCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
+
+
+ALTER TABLE Submitter ALTER COLUMN create_time SET DEFAULT NOW();
+ALTER TABLE Submitter ADD CONSTRAINT pk_Submitter  PRIMARY KEY   (handle ASC);
+ALTER TABLE TemplateType ADD CONSTRAINT pk_TemplateType  PRIMARY KEY   (temp_type_id ASC);
+ALTER TABLE UniGty ADD CONSTRAINT pk_UniGty  PRIMARY KEY   (unigty_id ASC);
+ALTER TABLE UniVariAllele ADD CONSTRAINT pk_UniVariAllele  PRIMARY KEY   (univar_id ASC,allele_id ASC);
+ALTER TABLE UniVariation ADD CONSTRAINT pk_UniVariation  PRIMARY KEY   (univar_id ASC);
+ALTER TABLE UniVariationSrcCode ADD CONSTRAINT pk_UniVariationSrcCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
+ALTER TABLE VariAllele ADD CONSTRAINT pk_VariAllele  PRIMARY KEY   (var_id ASC,allele_id ASC);
+ALTER TABLE db_ftp_table_list ALTER COLUMN create_time SET DEFAULT NOW();
+ALTER TABLE db_ftp_table_list ADD CONSTRAINT pk_db_ftp_table_list  PRIMARY KEY   (table_name ASC);
+ALTER TABLE db_map_table_name ALTER COLUMN inNonHuman SET DEFAULT 'N';
+ALTER TABLE db_map_table_name ADD CONSTRAINT pk_db_map_table_name  PRIMARY KEY   (table_name ASC);
+ALTER TABLE dn_Allele_rev ADD CONSTRAINT pk_dn_Allele_rev  PRIMARY KEY   (allele_id ASC,rev_flag ASC);
+ALTER TABLE dn_Motif_rev ADD CONSTRAINT pk_dn_Motif_rev  PRIMARY KEY   (motif_id ASC,rev_flag ASC);
+ALTER TABLE dn_UniGty_allele ADD CONSTRAINT pk_dn_UniGty_allele  PRIMARY KEY   (unigty_id ASC,chr_num ASC);
+ALTER TABLE dn_UniGty_rev ADD CONSTRAINT pk_dn_Gty_rev  PRIMARY KEY   (unigty_id ASC,rev_flag ASC);
+ALTER TABLE dn_UniVariation_rev ADD CONSTRAINT pk_dn_UniVariation_rev  PRIMARY KEY   (univar_id ASC,rev_flag ASC);
+
+
+ALTER TABLE dn_summary ALTER COLUMN create_time SET DEFAULT NOW();
+ALTER TABLE dn_summary ALTER COLUMN last_updated_time SET DEFAULT NOW();
+ALTER TABLE dn_summary ADD CONSTRAINT PK__dn_summary__3651FAE7  PRIMARY KEY   (tax_id ASC,build_id ASC,type ASC);