schema/shared_schema/dbSNP_main_constraint_postgresql.sql

   1 ALTER TABLE Allele ADD \r
   2         CONSTRAINT pk_Allele PRIMARY KEY   \r
   3         (\r
   4                 allele_id\r
   5         )\r
   6 ;\r
   7 \r
   8 ALTER TABLE AlleleFlagCode ADD \r
   9         CONSTRAINT pk_AlleleFlagCode PRIMARY KEY   \r
  10         (\r
  11                 code\r
  12         )\r
  13 ;\r
  14 \r
  15 ALTER TABLE AlleleMotif ADD \r
  16         CONSTRAINT pk_AlleleMotif PRIMARY KEY   \r
  17         (\r
  18                 allele_id,\r
  19                 motif_order\r
  20         )\r
  21 ;\r
  22 \r
  23 ALTER TABLE AllocIds ADD \r
  24         CONSTRAINT pk_AllocIds PRIMARY KEY\r
  25         (\r
  26                 name\r
  27         )\r
  28 ;\r
  29 \r
  30 ALTER TABLE Author ADD \r
  31         CONSTRAINT pk_Author PRIMARY KEY\r
  32         (\r
  33                 pub_id,\r
  34                 position\r
  35         )\r
  36 ;\r
  37 \r
  38 \r
  39 \r
  40 ALTER TABLE CpGCode ADD \r
  41         CONSTRAINT pk_CpGCode PRIMARY KEY   \r
  42         (\r
  43                 code\r
  44         )\r
  45 ;\r
  46 \r
  47 \r
  48 \r
  49 -- ALTER TABLE GenomeBuildInfo ADD \r
  50 --      CONSTRAINT DF__GenomeBui__inser__15E52B55 DEFAULT (getdate()) FOR insert_time,\r
  51 --      CONSTRAINT DF__GenomeBui__is_ma__18C19800 DEFAULT (1) FOR is_major,\r
  52 --      CONSTRAINT DF__GenomeBui__ncbi___23FE4082 DEFAULT (0) FOR ncbi_genome_tax_id\r
  53 -- ;\r
  54 \r
  55 ALTER TABLE GtyAllele ADD \r
  56         CONSTRAINT pk_GtyAllele PRIMARY KEY   \r
  57         (\r
  58                 gty_id,\r
  59                 rev_flag,\r
  60                 chr_num\r
  61         )\r
  62 ;\r
  63 \r
  64 ALTER TABLE IUPACna ADD \r
  65         CONSTRAINT pk_IUPACna PRIMARY KEY   \r
  66         (\r
  67                 allele\r
  68         )\r
  69 ;\r
  70 \r
  71 ALTER TABLE LoadHistory ADD \r
  72         CONSTRAINT pk_LoadHistory PRIMARY KEY\r
  73         (\r
  74                 build_id\r
  75         )\r
  76 ;\r
  77 \r
  78 ALTER TABLE LocTypeCode ADD \r
  79 --      CONSTRAINT DF__LocTypeCo__creat__75CD617E DEFAULT (getdate()) FOR create_time,\r
  80         CONSTRAINT pk_LocTypeCode PRIMARY KEY   \r
  81         (\r
  82                 code\r
  83         )\r
  84 ;\r
  85 \r
  86 ALTER TABLE MapLinkCode ADD \r
  87         CONSTRAINT pk_MapLinkCode PRIMARY KEY   \r
  88         (\r
  89                 which_code,\r
  90                 code\r
  91         )\r
  92 ;\r
  93 \r
  94 ALTER TABLE Method ADD \r
  95         CONSTRAINT pk_Method_mid PRIMARY KEY   \r
  96         (\r
  97                 method_id\r
  98         )\r
  99 ;\r
 100 \r
 101 ALTER TABLE MethodClass ADD \r
 102         CONSTRAINT pk_MethodClass PRIMARY KEY   \r
 103         (\r
 104                 meth_class_id\r
 105         )\r
 106 ;\r
 107 \r
 108 ALTER TABLE MethodLine ADD \r
 109         CONSTRAINT pk_MethodLine PRIMARY KEY\r
 110         (\r
 111                 method_id,\r
 112                 line_num\r
 113         )\r
 114 ;\r
 115 \r
 116 ALTER TABLE Moltype ADD \r
 117         CONSTRAINT pk_Moltype PRIMARY KEY   \r
 118         (\r
 119                 code\r
 120         )\r
 121 ;\r
 122 \r
 123 ALTER TABLE Motif ADD \r
 124         CONSTRAINT pk_Motif PRIMARY KEY   \r
 125         (\r
 126                 motif_id\r
 127         )\r
 128 ;\r
 129 \r
 130 ALTER TABLE ObsGenotype ADD \r
 131         CONSTRAINT pk_ObsGenotype PRIMARY KEY   \r
 132         (\r
 133                 gty_id\r
 134         )\r
 135 ;\r
 136 \r
 137 ALTER TABLE ObsVariation ADD \r
 138 --      CONSTRAINT DF__ObsVariat__creat__3BB5CE82 DEFAULT (getdate()) FOR create_time,\r
 139 --      CONSTRAINT DF__ObsVariat__last___3CA9F2BB DEFAULT (getdate()) FOR last_updated_time,\r
 140         CONSTRAINT pk_ObsVariation PRIMARY KEY   \r
 141         (\r
 142                 var_id\r
 143         )\r
 144 ;\r
 145 \r
 146 ALTER TABLE OrgDbStatus ADD \r
 147         CONSTRAINT pk_org_db_status PRIMARY KEY   \r
 148         (\r
 149                 database_name\r
 150         )\r
 151 ;\r
 152 \r
 153 ALTER TABLE OrganismTax ADD \r
 154         CONSTRAINT pk_organism PRIMARY KEY\r
 155         (\r
 156                 tax_id\r
 157         )\r
 158 ;\r
 159 \r
 160 ALTER TABLE PopClass ADD \r
 161         CONSTRAINT pk_PopClass PRIMARY KEY   \r
 162         (\r
 163                 pop_id,\r
 164                 pop_class_id\r
 165         )\r
 166 ;\r
 167 \r
 168 ALTER TABLE PopClassCode ADD \r
 169         CONSTRAINT PK__PopClassCode__270595B6 PRIMARY KEY   \r
 170         (\r
 171                 pop_class_id\r
 172         )\r
 173 ;\r
 174 \r
 175 ALTER TABLE Publication ADD \r
 176         CONSTRAINT pk_Publication PRIMARY KEY\r
 177         (\r
 178                 pub_id\r
 179         )\r
 180 ;\r
 181 \r
 182 ALTER TABLE SNPGlossary ADD \r
 183 --      CONSTRAINT DF__SNPGlossa__last___4050666D DEFAULT (getdate()) FOR last_updated,\r
 184         CONSTRAINT pk_SNPGlossary PRIMARY KEY   \r
 185         (\r
 186                 term\r
 187         )\r
 188 ;\r
 189 \r
 190 ALTER TABLE SNP_tax_id ADD \r
 191 --      CONSTRAINT DF__SNP_tax_i__statu__31583BA0 DEFAULT ('C') FOR status,\r
 192         CONSTRAINT pk_SNP_tax_id PRIMARY KEY   \r
 193         (\r
 194                 snp_id\r
 195         )\r
 196 ;\r
 197 \r
 198 ALTER TABLE SnpChrCode ADD \r
 199         CONSTRAINT pk_SnpChrCode PRIMARY KEY   \r
 200         (\r
 201                 code\r
 202         )\r
 203 ;\r
 204 \r
 205 ALTER TABLE SnpClassCode ADD \r
 206         CONSTRAINT pk_SnpClassCode PRIMARY KEY   \r
 207         (\r
 208                 code\r
 209         )\r
 210 ;\r
 211 \r
 212 ALTER TABLE SnpFunctionCode ADD \r
 213         CONSTRAINT pk_SnpFunctionCode PRIMARY KEY   \r
 214         (\r
 215                 code\r
 216         )\r
 217 ;\r
 218 \r
 219 ALTER TABLE SnpValidationCode ADD \r
 220         CONSTRAINT pk_SnpValidationCode PRIMARY KEY\r
 221         (\r
 222                 code\r
 223         )\r
 224 ;\r
 225 \r
 226 ALTER TABLE StrandCode ADD \r
 227         CONSTRAINT pk_StrandCode PRIMARY KEY   \r
 228         (\r
 229                 code\r
 230         )\r
 231 ;\r
 232 \r
 233 \r
 234 \r
 235 ALTER TABLE Submitter ADD \r
 236 --      CONSTRAINT DF_Submitter_create_time DEFAULT (getdate()) FOR create_time,\r
 237         CONSTRAINT pk_Submitter PRIMARY KEY\r
 238         (\r
 239                 handle\r
 240         )\r
 241 ;\r
 242 \r
 243 ALTER TABLE TemplateType ADD \r
 244         CONSTRAINT pk_TemplateType PRIMARY KEY   \r
 245         (\r
 246                 temp_type_id\r
 247         )\r
 248 ;\r
 249 \r
 250 ALTER TABLE UniGty ADD \r
 251         CONSTRAINT pk_UniGty PRIMARY KEY   \r
 252         (\r
 253                 unigty_id\r
 254         )\r
 255 ;\r
 256 \r
 257 ALTER TABLE UniVariAllele ADD \r
 258         CONSTRAINT pk_UniVariAllele PRIMARY KEY   \r
 259         (\r
 260                 univar_id,\r
 261                 allele_id\r
 262         )\r
 263 ;\r
 264 \r
 265 ALTER TABLE UniVariation ADD \r
 266         CONSTRAINT pk_UniVariation PRIMARY KEY   \r
 267         (\r
 268                 univar_id\r
 269         )\r
 270 ;\r
 271 \r
 272 ALTER TABLE UniVariationSrcCode ADD \r
 273         CONSTRAINT pk_UniVariationSrcCode PRIMARY KEY   \r
 274         (\r
 275                 code\r
 276         )\r
 277 ;\r
 278 \r
 279 ALTER TABLE VariAllele ADD \r
 280         CONSTRAINT pk_VariAllele PRIMARY KEY   \r
 281         (\r
 282                 var_id,\r
 283                 allele_id\r
 284         )\r
 285 ;\r
 286 \r
 287 ALTER TABLE db_ftp_table_list ADD \r
 288 --      CONSTRAINT DF__db_ftp_ta__creat__27F9B9EF DEFAULT (getdate()) FOR create_time,\r
 289         CONSTRAINT pk_db_ftp_table_list PRIMARY KEY   \r
 290         (\r
 291                 table_name\r
 292         )\r
 293 ;\r
 294 \r
 295 -- ALTER TABLE db_map_table_name ADD \r
 296 --      CONSTRAINT DF__db_map_ta__inNon__206E7217 DEFAULT ('N') FOR inNonHuman\r
 297 -- ;\r
 298 \r
 299 ALTER TABLE dn_Allele_rev ADD \r
 300         CONSTRAINT pk_dn_Allele_rev PRIMARY KEY   \r
 301         (\r
 302                 allele_id,\r
 303                 rev_flag\r
 304         )\r
 305 ;\r
 306 \r
 307 ALTER TABLE dn_Motif_rev ADD \r
 308         CONSTRAINT pk_dn_Motif_rev PRIMARY KEY   \r
 309         (\r
 310                 motif_id,\r
 311                 rev_flag\r
 312         )\r
 313 ;\r
 314 \r
 315 ALTER TABLE dn_UniGty_allele ADD \r
 316         CONSTRAINT pk_dn_UniGty_allele PRIMARY KEY   \r
 317         (\r
 318                 unigty_id,\r
 319                 chr_num\r
 320         )\r
 321 ;\r
 322 \r
 323 ALTER TABLE dn_UniGty_rev ADD \r
 324         CONSTRAINT pk_dn_Gty_rev PRIMARY KEY   \r
 325         (\r
 326                 unigty_id,\r
 327                 rev_flag\r
 328         )\r
 329 ;\r
 330 \r
 331 ALTER TABLE dn_UniVariation_rev ADD \r
 332         CONSTRAINT pk_dn_UniVariation_rev PRIMARY KEY   \r
 333         (\r
 334                 univar_id,\r
 335                 rev_flag\r
 336         )\r
 337 ;\r
 338 \r
 339 \r
 340 \r
 341 ALTER TABLE dn_summary ADD \r
 342 --      CONSTRAINT DF__dn_summar__creat__383A4359 DEFAULT (getdate()) FOR create_time,\r
 343 --      CONSTRAINT DF__dn_summar__last___392E6792 DEFAULT (getdate()) FOR last_updated_time,\r
 344          PRIMARY KEY   \r
 345         (\r
 346                 tax_id,\r
 347                 build_id,\r
 348                 type\r
 349         )\r
 350 ;\r
 351 \r