schema/human_9606_schema/human_9606_index_postgresql.sql

   1
   2  CREATE  INDEX ON Batch(tax_id)
   3 ;
   4  CREATE  INDEX ON Batch(submitted_time)
   5 ;
   6  CREATE  INDEX ON Batch(handle, loc_batch_id)
   7 ;
   8  CREATE  INDEX ON Batch(pop_id)
   9 ;
  10  CREATE  INDEX ON Batch(success_rate_int)
  11 ;
  12  CREATE  INDEX ON Batch(method_id)
  13 ;
  14  CREATE  INDEX ON Batch(loc_batch_id_upp)
  15 ;
  16  CREATE  INDEX ON Batch(last_updated_time)
  17 ;
  18
  19  CREATE  INDEX ON BatchCita(pub_id)
  20 ;
  21
  22
  23  CREATE  INDEX ON BatchCultivar(line)
  24 ;
  25
  26
  27  CREATE  INDEX ON BatchStrain(line)
  28 ;
  29
  30
  31
  32
  33
  34
  35
  36
  37
  38
  39
  40  CREATE  UNIQUE  INDEX ON Pedigree(curator, curator_ped_id)
  41 ;
  42
  43  CREATE  UNIQUE  INDEX ON PedigreeIndividual(ind_id, ped_id)
  44 ;
  45
  46
  47  CREATE  UNIQUE    INDEX ON PopMandLine(pop_id, line_num)
  48 ;
  49
  50  CREATE  UNIQUE  INDEX ON Population(handle, loc_pop_id_upp)
  51 ;
  52  CREATE  UNIQUE  INDEX ON Population(handle, loc_pop_id)
  53 ;
  54
  55
  56  CREATE  UNIQUE    INDEX ON SNP(snp_id)
  57 ;
  58  CREATE  INDEX ON SNP(exemplar_subsnp_id, snp_id)
  59 ;
  60
  61  CREATE  INDEX ON SNP3D(snp_id)
  62 ;
  63
  64
  65
  66
  67
  68  CREATE  INDEX ON SNPHistory(history_create_time)
  69 ;
  70
  71
  72  CREATE  UNIQUE    INDEX ON SNPSubSNPLink(subsnp_id)
  73 ;
  74  CREATE  INDEX ON SNPSubSNPLink(snp_id, subsnp_id, substrand_reversed_flag)
  75 ;
  76
  77  CREATE    INDEX ON SNPSubSNPLinkHistory(snp_id)
  78 ;
  79  CREATE  UNIQUE  INDEX ON SNPSubSNPLinkHistory(subsnp_id, snp_id)
  80 ;
  81  CREATE  INDEX ON SNPSubSNPLinkHistory(build_id)
  82 ;
  83  CREATE  INDEX ON SNPSubSNPLinkHistory(build_id_when_history_made)
  84 ;
  85
  86  CREATE  INDEX ON SNPVal(snp_id)
  87 ;
  88
  89  CREATE  UNIQUE    INDEX ON SNP_HGVS(snp_id, hgvs_name)
  90 ;
  91
  92  CREATE  INDEX ON SNP_bitfield(link_prop_b2)
  93 ;
  94
  95  CREATE  INDEX ON SubPop(subsnp_id)
  96 ;
  97  CREATE  INDEX ON SubPop(pop_id, subsnp_id)
  98 ;
  99  CREATE  INDEX ON SubPop(subpop_id)
 100 ;
 101
 102  CREATE  UNIQUE    INDEX ON SubPopAllele(batch_id, pop_id, subsnp_id, type, allele, other)
 103 ;
 104  CREATE  INDEX ON SubPopAllele(freq)
 105 ;
 106  CREATE  INDEX ON SubPopAllele(freq_max)
 107 ;
 108  CREATE  INDEX ON SubPopAllele(freq_min)
 109 ;
 110  CREATE  INDEX ON SubPopAllele(subsnp_id)
 111 ;
 112  CREATE  INDEX ON SubPopAllele(type)
 113 ;
 114  CREATE  INDEX ON SubPopAllele(last_updated_time)
 115 ;
 116  CREATE  INDEX ON SubPopAllele(allele_id)
 117 ;
 118  CREATE  INDEX ON SubPopAllele(subpop_id)
 119 ;
 120  CREATE  UNIQUE  INDEX ON SubPopAllele(subpop_id, type, allele, other)
 121 ;
 122
 123  CREATE  INDEX ON SubPopGty(subpop_id)
 124 ;
 125  CREATE  INDEX ON SubPopGty(gty_id)
 126 ;
 127
 128  CREATE  INDEX ON SubSNP(loc_snp_id_upp, subsnp_id)
 129 ;
 130  CREATE  INDEX ON SubSNP(batch_id, subsnp_id)
 131 ;
 132
 133  CREATE  INDEX ON SubSNPAcc_ins(acc_part, acc_type_ind, subsnp_id)
 134 ;
 135
 136
 137
 138
 139  CREATE  INDEX ON SubSNPMdFailLn(subsnp_id)
 140 ;
 141
 142
 143
 144  CREATE  INDEX ON SubSNPPubmed(pubmed_id)
 145 ;
 146
 147
 148
 149
 150
 151  CREATE  UNIQUE  INDEX ON SubmittedIndividual(submitted_ind_id)
 152 ;
 153  CREATE  INDEX ON SubmittedIndividual(ind_id)
 154 ;
 155
 156
 157  CREATE  UNIQUE  INDEX ON b132_ContigInfo_37_1(contig_name)
 158 ;
 159  CREATE  INDEX ON b132_ContigInfo_37_1(contig_label)
 160 ;
 161  CREATE  INDEX ON b132_ContigInfo_37_1(group_term)
 162 ;
 163  CREATE  UNIQUE  INDEX ON b132_ContigInfo_37_1(contig_gi)
 164 ;
 165  CREATE  INDEX ON b132_ContigInfo_37_1(ctg_id)
 166 ;
 167  CREATE  INDEX ON b132_ContigInfo_37_1(contig_name, contig_acc)
 168 ;
 169
 170  CREATE  INDEX ON b132_GenomeAssemblyInfo_37_1(rep_order, assembly)
 171 ;
 172
 173  CREATE  INDEX ON b132_MapLinkInfo_37_1(gi)
 174 ;
 175
 176  CREATE    INDEX ON b132_MapLink_37_1(snp_id, gi)
 177 ;
 178  CREATE  INDEX ON b132_MapLink_37_1(gi, "offset", asn_to)
 179 ;
 180
 181
 182  CREATE  UNIQUE    INDEX ON b132_SNPChrPosOnRef_37_1(snp_id)
 183 ;
 184
 185  CREATE  UNIQUE    INDEX ON b132_SNPContigLoc_37_1(snp_id, ctg_id, asn_from)
 186 ;
 187  CREATE  INDEX ON b132_SNPContigLoc_37_1(ctg_id, asn_from)
 188 ;
 189  CREATE  INDEX ON b132_SNPContigLoc_37_1(snp_type, snp_id)
 190 ;
 191  CREATE  INDEX ON b132_SNPContigLoc_37_1(ctg_id, snp_id)
 192 ;
 193
 194  CREATE  UNIQUE    INDEX ON b132_SNPContigLocusId_37_1(locus_id, contig_acc, mrna_gi, snp_id, asn_from, allele, mrna_start)
 195 ;
 196  CREATE  INDEX ON b132_SNPContigLocusId_37_1(snp_id)
 197 ;
 198
 199  CREATE  UNIQUE    INDEX ON b132_SNPMapInfo_37_1(snp_id, assembly)
 200 ;
 201
 202
 203  CREATE    INDEX ON dn_IND_batch_pop(pop_id)
 204 ;
 205
 206
 207
 208
 209
 210  CREATE    INDEX ON dn_table_rowcount(build_id DESC , reserved_KB_spaceused DESC )
 211 ;
 212