trunk/R/debcontrol.R

   1 get_dependencies <- function(pkg,extra_deps,verbose=TRUE) {
   2     # determine dependencies
   3     dependencies <- r_dependencies_of(description=pkg$description)
   4     depends <- list()
   5     # these are used for generating the Depends fields
   6     as_deb <- function(r,build) {
   7         return(pkgname_as_debian(paste(dependencies[r,]$name)
   8                                 ,version=dependencies[r,]$version
   9                                 ,repopref=pkg$repo
  10                                 ,build=build))
  11     }
  12     depends$bin <- lapply(rownames(dependencies), as_deb, build=F)
  13     depends$build <- lapply(rownames(dependencies), as_deb, build=T)
  14     # add the command line dependencies
  15     depends$bin = c(extra_deps$deb,depends$bin)
  16     depends$build = c(extra_deps$deb,depends$build)
  17     ## add R:Depends
  18     depends$bin = c(depends$bin,'${R:Depends}');
  19     # add the system requirements
  20     if ('SystemRequirements' %in% colnames(pkg$description)) {
  21         sysreq <- sysreqs_as_debian(pkg$description[1,'SystemRequirements'],verbose=verbose)
  22         if (!is.null(sysreq) && is.list(sysreq)) {
  23             depends$bin = c(sysreq$bin,depends$bin)
  24             depends$build = c(sysreq$build,depends$build)
  25         } else {
  26             if (verbose) {cat("sysreq:"); print(sysreq)}
  27             fail('Cannot interpret system dependency, fix package.\n')
  28         }
  29     }
  30
  31     forced <- forced_deps_as_debian(pkg$name)
  32     if (length(forced)) {
  33         notice('forced build dependencies:',paste(forced$build, collapse=', '))
  34         notice('forced binary dependencies:',paste(forced$bin, collapse=', '))
  35         depends$bin = c(forced$bin,depends$bin)
  36         depends$build = c(forced$build,depends$build)
  37     }
  38
  39     # make sure we depend upon R in some way...
  40     if (!length(grep('^r-base',depends$build))) {
  41         depends$build = c(depends$build,pkgname_as_debian('R',version='>= 2.7.0',build=T))
  42         depends$bin   = c(depends$bin,  pkgname_as_debian('R',version='>= 2.7.0',build=F))
  43     }
  44     # also include stuff to allow tcltk to build (suggested by Dirk)
  45     depends$build = c(depends$build,'xvfb','xauth','xfonts-base')
  46
  47     # make all bin dependencies build dependencies.
  48     depends$build = c(depends$build, depends$bin)
  49
  50     # remove duplicates
  51     depends <- lapply(depends,unique)
  52
  53     # append the Debian dependencies
  54     depends$build=c(depends$build,'debhelper (>> 4.1.0)','cdbs')
  55     if (file.exists(file.path(patch_dir, pkg$name))) {
  56         depends$build <- c(depends$build,'dpatch')
  57     }
  58     if (pkg$archdep) {
  59         depends$bin=c(depends$bin,'${shlibs:Depends}')
  60     }
  61
  62     # the names of dependent source packages (to find the .changes file to
  63     # upload via dput). these can be found recursively.
  64     depends$r = r_dependency_closure(dependencies)
  65     # append command line dependencies
  66     depends$r = c(extra_deps$r, depends$r)
  67     return(depends)
  68 }
  69
  70 sysreqs_as_debian <- function(sysreq_text,verbose=FALSE) {
  71     # form of this field is unspecified (ugh) but most people seem to stick
  72     # with this
  73     aliases <- c()
  74     # drop notes
  75     sysreq_text = gsub('[Nn][Oo][Tt][Ee]:\\s.*','',sysreq_text)
  76     # conversion from and to commata and lower case
  77     sysreq_text <- gsub('[[:space:]]and[[:space:]]',' , ',tolower(sysreq_text))
  78     for (sysreq in strsplit(sysreq_text,'[[:space:]]*,[[:space:]]*')[[1]]) {
  79         if (verbose) cat("sysreq to investigate: '",sysreq,"'.\n",sep="")
  80         startreq = sysreq
  81         # constant case (redundant)
  82         sysreq = tolower(sysreq)
  83         # drop version information/comments for now
  84         sysreq = gsub('[[][^])]*[]]','',sysreq)
  85         sysreq = gsub('\\([^)]*\\)','',sysreq)
  86         sysreq = gsub('[[][^])]*[]]','',sysreq)
  87         sysreq = gsub('version','',sysreq)
  88         sysreq = gsub('from','',sysreq)
  89         sysreq = gsub('[<>=]*[[:space:]]*[[:digit:]]+[[:digit:].+:~-]*','',sysreq)
  90         # byebye URLs
  91         sysreq = gsub('(ht|f)tps?://[[:alnum:]!?*"\'(),%$_@.&+/=-]*','',sysreq)
  92         # squish out space -- this does not work for me (did not want to touch, though), Steffen
  93         sysreq = chomp(gsub('[[:space:]]+',' ',sysreq))
  94         # no final dot and neither final blanks
  95         sysreq = gsub('\\.?\\s*$','',sysreq)
  96         if (nchar(sysreq) == 0) {
  97             notice('part of the SystemRequirement became nothing')
  98             next
  99         }
 100         alias <- db_sysreq_override(sysreq)
 101         if (is.null(alias)) {
 102             error('do not know what to do with SystemRequirement:',sysreq)
 103             error('original SystemRequirement:',startreq)
 104             fail('unmet system requirement')
 105         }
 106         notice(paste("mapped SystemRequirement '",startreq,"' onto '",alias,"' via '",sysreq,"'.",sep=""))
 107         aliases = c(aliases,alias)
 108     }
 109     return(map_aliases_to_debian(aliases))
 110 }
 111
 112 forced_deps_as_debian <- function(r_name) {
 113     aliases <- db_get_forced_depends(r_name)
 114     return(map_aliases_to_debian(aliases))
 115 }
 116
 117 map_aliases_to_debian <- function(aliases) {
 118     if (!length(aliases)) {
 119         return(aliases)
 120     }
 121     debs <- list()
 122     debs$bin = unlist(sapply(aliases, db_get_depends))
 123     debs$build = unlist(sapply(aliases, db_get_depends, build=T))
 124     debs$bin = debs$bin[debs$bin != 'build-essential']
 125     debs$build = debs$build[debs$build != 'build-essential']
 126     return(debs)
 127 }
 128
 129 generate_control <- function(pkg) {
 130     # construct control file
 131
 132     control <- data.frame()
 133     control[1,'Source'] <- pkg$srcname
 134     control[1,'Section'] <- 'gnu-r'
 135     control[1,'Priority'] <- 'optional'
 136     control[1,'Maintainer'] <- maintainer
 137     control[1,'Build-Depends'] <- paste(pkg$depends$build, collapse=', ')
 138     control[1,'Standards-Version'] <- '3.9.1'
 139     if ('URL' %in% colnames(pkg$description)) {
 140         control[1,'Homepage'] <- pkg$description[1,'URL']
 141     }
 142
 143     control[2,'Package'] <- pkg$debname
 144     control[2,'Architecture'] <- 'all'
 145     if (pkg$archdep) {
 146         control[2,'Architecture'] <- 'any'
 147     }
 148     control[2,'Depends'] <- paste(pkg$depends$bin,collapse=', ',sep='')
 149
 150     # generate the description
 151     descr <- 'GNU R package "'
 152     if ('Title' %in% colnames(pkg$description)) {
 153         descr <- paste(descr,pkg$description[1,'Title'],sep='')
 154     } else {
 155         descr <- paste(descr,pkg$name,sep='')
 156     }
 157     long_descr <- pkg$description[1,'Description']
 158
 159     if (length(long_descr) < 1 || long_descr == "") {
 160         # bypass lintian extended-description-is-empty for which we care not.
 161         long_descr <- paste('The author/maintainer of this package'
 162                            ,'did not care to enter a longer description.')
 163     }
 164
 165     # using \n\n.\n\n is not very nice, but is necessary to make sure
 166     # the longer description does not begin on the synopsis line --- R's
 167     # write.dcf does not appear to have a nicer way of doing this.
 168     descr <- paste(descr,'"\n\n', long_descr, sep='')
 169     # add some extra nice info about the original R package
 170     for (r_info in c('Author','Maintainer')) {
 171         if (r_info %in% colnames(pkg$description)) {
 172             descr <- paste(descr,'\n\n',r_info,': ',pkg$description[1,r_info],sep='')
 173         }
 174     }
 175     if (Encoding(descr) == "unknown")
 176         Encoding(descr) <- "latin1"     # or should it be UTF-8
 177
 178     control[2,'Description'] <- descr
 179
 180     # Debian policy says 72 char width; indent minimally
 181     write.dcf(control,file=pkg$debfile('control.in'),indent=1,width=72)
 182     write.dcf(control,indent=1,width=72)
 183 }
 184