branch/multisys/R/db.R

   1
   2 db_start <- function() {
   3     drv <- dbDriver('SQLite')
   4     con <- dbConnect(drv, dbname=file.path(cache_root,'cran2deb.db'))
   5     if (!dbExistsTable(con,'sysreq_override')) {
   6         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE sysreq_override ('
   7                   ,' depend_alias TEXT NOT NULL'
   8                   ,',r_pattern TEXT PRIMARY KEY NOT NULL'
   9                   ,')'))
  10     }
  11     if (!dbExistsTable(con,'debian_dependency')) {
  12         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE debian_dependency ('
  13                   ,' id INTEGER PRIMARY KEY AUTOINCREMENT NOT NULL'
  14                   ,',alias TEXT NOT NULL'
  15                   ,',build INTEGER NOT NULL'
  16                   ,',debian_pkg TEXT NOT NULL'
  17                   ,',UNIQUE (alias,build,debian_pkg)'
  18                   ,')'))
  19     }
  20     if (!dbExistsTable(con,'forced_depends')) {
  21         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE forced_depends ('
  22                   ,' r_name TEXT NOT NULL'
  23                   ,',depend_alias TEXT NOT NULL'
  24                   ,',PRIMARY KEY (r_name,depend_alias)'
  25                   ,')'))
  26     }
  27     if (!dbExistsTable(con,'license_override')) {
  28         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE license_override ('
  29                   ,' name TEXT PRIMARY KEY NOT NULL'
  30                   ,',accept INT NOT NULL'
  31                   ,')'))
  32     }
  33     if (!dbExistsTable(con,'license_hashes')) {
  34         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE license_hashes ('
  35                   ,' name TEXT NOT NULL'
  36                   ,',sha1 TEXT PRIMARY KEY NOT NULL'
  37                   ,')'))
  38     }
  39     if (!dbExistsTable(con,'database_versions')) {
  40         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE database_versions ('
  41                   ,' version INTEGER PRIMARY KEY AUTOINCREMENT NOT NULL'
  42                   ,',version_date INTEGER NOT NULL'
  43                   ,',base_epoch INTEGER NOT NULL'
  44                   ,')'))
  45         db_add_version(con,1,0)
  46     }
  47     if (!dbExistsTable(con,'packages')) {
  48         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE packages ('
  49                   ,' package TEXT PRIMARY KEY NOT NULL'
  50                   ,',latest_r_version TEXT'
  51                   ,')'))
  52     }
  53     if (!dbExistsTable(con,'builds')) {
  54         dbGetQuery(con,paste('CREATE TABLE builds ('
  55                   ,' id INTEGER PRIMARY KEY AUTOINCREMENT NOT NULL'
  56                   ,',package TEXT NOT NULL'
  57                   ,',r_version TEXT NOT NULL'
  58                   ,',deb_epoch INTEGER NOT NULL'
  59                   ,',deb_revision INTEGER NOT NULL'
  60                   ,',db_version INTEGER NOT NULL'
  61                   ,',date_stamp TEXT NOT NULL'
  62                   ,',git_revision TEXT NOT NULL'  # legacy: really scm_revision
  63                   ,',success INTEGER NOT NULL'
  64                   ,',log TEXT'
  65                   ,',UNIQUE(package,r_version,deb_epoch,deb_revision,db_version)'
  66                   ,')'))
  67     }
  68     return(con)
  69 }
  70
  71 db_stop <- function(con,bump=F) {
  72     if (bump) {
  73         db_bump(con)
  74     }
  75     dbDisconnect(con)
  76 }
  77
  78 db_quote <- function(text) {
  79     return(paste('\'', gsub('([\'"])','\\1\\1',text),'\'',sep=''))
  80 }
  81
  82 db_now <- function() {
  83     return(as.integer(gsub('-','',Sys.Date())))
  84 }
  85
  86 db_cur_version <- function(con) {
  87     return(as.integer(dbGetQuery(con, 'SELECT max(version) FROM database_versions')[[1]]))
  88 }
  89
  90 db_base_epoch <- function(con) {
  91     return(as.integer(dbGetQuery(con,
  92         paste('SELECT max(base_epoch) FROM database_versions'
  93              ,'WHERE version IN (SELECT max(version) FROM database_versions)'))[[1]]))
  94 }
  95
  96 db_get_base_epoch <- function() {
  97     con <- db_start()
  98     v <- db_base_epoch(con)
  99     db_stop(con)
 100     return(v)
 101 }
 102
 103 db_get_version <- function() {
 104     con <- db_start()
 105     v <- db_cur_version(con)
 106     db_stop(con)
 107     return(v)
 108 }
 109
 110 db_add_version <- function(con, version, epoch) {
 111     dbGetQuery(con,paste('INSERT INTO database_versions (version,version_date,base_epoch)'
 112               ,'VALUES (',as.integer(version),',',db_now(),',',as.integer(epoch),')'))
 113 }
 114
 115 db_bump <- function(con) {
 116     db_add_version(con,db_cur_version(con)+1, db_base_epoch(con))
 117 }
 118
 119 db_bump_epoch <- function(con) {
 120     db_add_version(con,db_cur_version(con)+1, db_base_epoch(con)+1)
 121 }
 122
 123 db_sysreq_override <- function(sysreq_text) {
 124     con <- db_start()
 125     results <- dbGetQuery(con,paste(
 126                     'SELECT DISTINCT depend_alias FROM sysreq_override WHERE'
 127                             ,db_quote(tolower(sysreq_text)),'LIKE r_pattern'))
 128     db_stop(con)
 129     if (length(results) == 0) {
 130         return(NULL)
 131     }
 132     return(results$depend_alias)
 133 }
 134
 135 db_add_sysreq_override <- function(pattern,depend_alias) {
 136     con <- db_start()
 137     results <- dbGetQuery(con,paste(
 138                      'INSERT OR REPLACE INTO sysreq_override'
 139                     ,'(depend_alias, r_pattern) VALUES ('
 140                     ,' ',db_quote(tolower(depend_alias))
 141                     ,',',db_quote(tolower(pattern))
 142                     ,')'))
 143     db_stop(con,TRUE)
 144 }
 145
 146 db_sysreq_overrides <- function() {
 147     con <- db_start()
 148     overrides <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM sysreq_override'))
 149     db_stop(con)
 150     return(overrides)
 151 }
 152
 153 db_get_depends <- function(depend_alias,build=F) {
 154     con <- db_start()
 155     results <- dbGetQuery(con,paste(
 156                     'SELECT DISTINCT debian_pkg FROM debian_dependency WHERE'
 157                     ,db_quote(tolower(depend_alias)),'= alias'
 158                     ,'AND',as.integer(build),'= build'))
 159     db_stop(con)
 160     return(results$debian_pkg)
 161 }
 162
 163 db_add_depends <- function(depend_alias,debian_pkg,build=F) {
 164     con <- db_start()
 165     results <- dbGetQuery(con,paste(
 166                      'INSERT OR REPLACE INTO debian_dependency'
 167                     ,'(alias, build, debian_pkg) VALUES ('
 168                     ,' ',db_quote(tolower(depend_alias))
 169                     ,',',as.integer(build)
 170                     ,',',db_quote(tolower(debian_pkg))
 171                     ,')'))
 172     db_stop(con,TRUE)
 173 }
 174
 175 db_depends <- function() {
 176     con <- db_start()
 177     depends <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM debian_dependency'))
 178     db_stop(con)
 179     return(depends)
 180 }
 181
 182 db_get_forced_depends <- function(r_name) {
 183     con <- db_start()
 184     forced_depends <- dbGetQuery(con,
 185                 paste('SELECT depend_alias FROM forced_depends WHERE'
 186                      ,db_quote(r_name),'= r_name'))
 187     db_stop(con)
 188     return(forced_depends$depend_alias)
 189 }
 190
 191 db_add_forced_depends <- function(r_name, depend_alias) {
 192     if (!length(db_get_depends(depend_alias,build=F)) &&
 193         !length(db_get_depends(depend_alias,build=T))) {
 194         fail('Debian dependency alias',depend_alias,'is not know,'
 195                   ,'yet trying to force a dependency on it?')
 196     }
 197     con <- db_start()
 198     dbGetQuery(con,
 199             paste('INSERT OR REPLACE INTO forced_depends (r_name, depend_alias)'
 200                  ,'VALUES (',db_quote(r_name),',',db_quote(depend_alias),')'))
 201     db_stop(con,TRUE)
 202 }
 203
 204 db_forced_depends <- function() {
 205     con <- db_start()
 206     depends <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM forced_depends'))
 207     db_stop(con)
 208     return(depends)
 209 }
 210
 211 db_license_override_name <- function(name) {
 212     con <- db_start()
 213     results <- dbGetQuery(con,paste(
 214                     'SELECT DISTINCT accept FROM license_override WHERE'
 215                             ,db_quote(tolower(name)),'= name'))
 216     db_stop(con)
 217     if (length(results) == 0) {
 218         return(NULL)
 219     }
 220     return(as.logical(results$accept))
 221 }
 222
 223 db_add_license_override <- function(name,accept) {
 224     notice('adding',name,'accept?',accept)
 225     if (accept != TRUE && accept != FALSE) {
 226         fail('accept must be TRUE or FALSE')
 227     }
 228     con <- db_start()
 229     results <- dbGetQuery(con,paste(
 230                      'INSERT OR REPLACE INTO license_override'
 231                     ,'(name, accept) VALUES ('
 232                     ,' ',db_quote(tolower(name))
 233                     ,',',as.integer(accept)
 234                     ,')'))
 235     db_stop(con,TRUE)
 236 }
 237
 238 db_license_override_hash <- function(license_sha1) {
 239     con <- db_start()
 240     results <- dbGetQuery(con,paste(
 241                      'SELECT DISTINCT accept FROM license_override'
 242                     ,'INNER JOIN license_hashes'
 243                     ,'ON license_hashes.name = license_override.name WHERE'
 244                     ,db_quote(tolower(license_sha1)),'= license_hashes.sha1'))
 245     db_stop(con)
 246     if (length(results) == 0) {
 247         return(NULL)
 248     }
 249     return(as.logical(results$accept))
 250 }
 251
 252 db_license_overrides <- function() {
 253     con <- db_start()
 254     overrides <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM license_override'))
 255     hashes    <- dbGetQuery(con,paste('SELECT * FROM license_hashes'))
 256     db_stop(con)
 257     return(list(overrides=overrides,hashes=hashes))
 258 }
 259
 260 db_add_license_hash <- function(name,license_sha1) {
 261     if (is.null(db_license_override_name(name))) {
 262         fail('license',name,'is not know, yet trying to add a hash for it?')
 263     }
 264     notice('adding hash',license_sha1,'for',name)
 265     con <- db_start()
 266     dbGetQuery(con,paste(
 267          'INSERT OR REPLACE INTO license_hashes'
 268         ,'(name, sha1) VALUES ('
 269         ,' ',db_quote(tolower(name))
 270         ,',',db_quote(tolower(license_sha1))
 271         ,')'))
 272     db_stop(con,TRUE)
 273 }
 274
 275
 276 db_update_package_versions <- function() {
 277     con <- db_start()
 278     for (package in available[,'Package']) {
 279         dbGetQuery(con, paste('INSERT OR REPLACE INTO packages (package,latest_r_version)'
 280                              ,'VALUES (',db_quote(package)
 281                              ,',',db_quote(available[package,'Version']),')'))
 282     }
 283     db_stop(con)
 284 }
 285
 286 db_record_build <- function(package, deb_version, log, success=F) {
 287     con <- db_start()
 288     dbGetQuery(con,paste('INSERT OR REPLACE INTO builds'
 289                         ,'(package,r_version,deb_epoch,deb_revision,db_version,success,date_stamp,git_revision,log)'
 290                         ,'VALUES'
 291                         ,'(',db_quote(package)
 292                         ,',',db_quote(version_upstream(deb_version))
 293                         ,',',db_quote(version_epoch(deb_version))
 294                         ,',',db_quote(version_revision(deb_version))
 295                         ,',',db_cur_version(con)
 296                         ,',',as.integer(success)
 297                         ,',',db_quote(format(Sys.time(),'%a, %d %b %Y %H:%M:%S %z'))
 298                         ,',',db_quote(scm_revision)
 299                         ,',',db_quote(paste(log, collapse='\n'))
 300                         ,')'))
 301     db_stop(con)
 302 }
 303
 304 db_builds <- function(pkgname) {
 305     # returns all successful builds
 306     con <- db_start()
 307     build <- dbGetQuery(con, paste('SELECT * FROM builds'
 308                        ,'WHERE success = 1'
 309                        ,'AND package =',db_quote(pkgname)))
 310     db_stop(con)
 311     if (length(build) == 0) {
 312         return(NULL)
 313     }
 314     build$success <- as.logical(build$success)
 315     return(build)
 316 }
 317
 318 db_latest_build <- function(pkgname) {
 319     con <- db_start()
 320     build <- dbGetQuery(con, paste('SELECT * FROM builds'
 321                        ,'NATURAL JOIN (SELECT package,max(id) AS max_id FROM builds'
 322                        ,              'GROUP BY package) AS last'
 323                        ,'WHERE id = max_id'
 324                        ,'AND builds.package =',db_quote(pkgname)))
 325     db_stop(con)
 326     if (length(build) == 0) {
 327         return(NULL)
 328     }
 329     build$success <- as.logical(build$success)
 330     return(build)
 331 }
 332
 333 db_latest_build_version <- function(pkgname) {
 334     build <- db_latest_build(pkgname)
 335     if (is.null(build)) {
 336         return(NULL)
 337     }
 338     return(version_new(build$r_version, build$deb_revision, build$deb_epoch))
 339 }
 340
 341 db_latest_build_status <- function(pkgname) {
 342     build <- db_latest_build(pkgname)
 343     if (is.null(build)) {
 344         return(NULL)
 345     }
 346     return(list(build$success,build$log))
 347 }
 348
 349 db_outdated_packages <- function() {
 350     con <- db_start()
 351     packages <- dbGetQuery(con,paste('SELECT packages.package FROM packages'
 352                ,'LEFT OUTER JOIN ('
 353                # extract the latest attempt at building each package
 354                ,      'SELECT * FROM builds'
 355                ,      'NATURAL JOIN (SELECT package,max(id) AS max_id FROM builds'
 356                ,                    'GROUP BY package) AS last'
 357                ,      'WHERE id = max_id) AS build'
 358                ,'ON build.package = packages.package'
 359                # outdated iff:
 360                # - there is no latest build
 361                ,'WHERE build.package IS NULL'
 362                # - the database has changed since last build
 363                ,'OR build.db_version < (SELECT max(version) FROM database_versions)'
 364                # - the debian epoch has been bumped up
 365                ,'OR build.deb_epoch < (SELECT max(base_epoch) FROM database_versions'
 366                ,                        'WHERE version IN ('
 367                ,                            'SELECT max(version) FROM database_versions))'
 368                # - the latest build is not of the latest R version
 369                ,'OR build.r_version != packages.latest_r_version'
 370                ))$package
 371     db_stop(con)
 372     return(packages)
 373 }
 374