]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blob - code_ruby/test/maasha/test_bitarray.rb
rewrite of FASTQ internals
[biopieces.git] / code_ruby / test / maasha / test_bitarray.rb
1 #!/usr/bin/env ruby
2 $:.unshift File.join(File.dirname(__FILE__), '..', '..')
3
4 # Copyright (C) 2007-2013 Martin A. Hansen.
5
6 # This program is free software; you can redistribute it and/or
7 # modify it under the terms of the GNU General Public License
8 # as published by the Free Software Foundation; either version 2
9 # of the License, or (at your option) any later version.
10
11 # This program is distributed in the hope that it will be useful,
12 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
13 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
14 # GNU General Public License for more details.
15
16 # You should have received a copy of the GNU General Public License
17 # along with this program; if not, write to the Free Software
18 # Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
19
20 # http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html
21
22 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
23
24 # This software is part of the Biopieces framework (www.biopieces.org).
25
26 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
27
28
29 require 'maasha/bitarray'
30 require 'test/unit'
31 require 'test/helper'
32
33 class TestBitArray < Test::Unit::TestCase 
34   def setup
35     @ba = BitArray.new(10)
36   end
37
38   test "BitArray.new raises on bad sizes" do
39     [ -1, 0, 1.1, "a" ].each do |size|
40       assert_raise(BitArrayError) { BitArray.new(size) }
41     end
42   end
43
44   test "BitArray.new dont raise on ok sizes" do
45     [ 1, 10, 1000 ].each do |size|
46       assert_nothing_raised { BitArray.new(size) }
47     end
48   end
49
50   test "#size returns correctly" do
51     assert_equal(10, @ba.size)
52   end
53
54   test "#to_s returns correctly" do
55     assert_equal("0000000000", @ba.to_s)
56   end
57
58   test "#fill returns correctly" do
59     assert_equal("1111111111", @ba.fill!.to_s)
60   end
61
62   test "#clear returns correctly" do
63     assert_equal("0000000000", @ba.fill!.clear!.to_s)
64   end
65
66   test "#bit_set with bad pos raises" do
67     [-1, 10, 1.1].each do |pos|
68       assert_raise(BitArrayError) { @ba.bit_set(pos) }
69     end
70   end
71
72   test "#bit_unset" do
73     @ba.fill!
74
75     str = "1111111111"
76
77     (0.upto 9).each do |pos|
78       @ba.bit_unset(pos)
79       str[pos] = "0"
80       assert_equal(str, @ba.to_s)
81     end
82   end
83
84   test "#bit_unset with bad pos raises" do
85     [-1, 10, 1.1].each do |pos|
86       assert_raise(BitArrayError) { @ba.bit_unset(pos) }
87     end
88   end
89
90   test "#bit_set? with bad pos raises" do
91     [-1, 10, 1.1].each do |pos|
92       assert_raise(BitArrayError) { @ba.bit_set?(pos) }
93     end
94   end
95
96   test "#bit_set? returns correctly" do
97     (0.upto 9).each do |pos|
98       @ba.bit_set(pos)
99       assert_equal(true, @ba.bit_set?(pos))
100     end
101   end
102
103   test "#bits_on returns correctly" do
104     @ba.bit_set(4)
105     @ba.bit_set(0)
106     @ba.bit_set(1)
107     assert_equal(3, @ba.bits_on)
108   end
109
110   test "#bits_off returns correctly" do
111     @ba.bit_set(4)
112     assert_equal(9, @ba.bits_off)
113   end
114
115   test "#& with uneven sizes raises" do
116     ba = BitArray.new(11)
117     assert_raise(BitArrayError) { @ba & ba }
118   end
119
120   test "#& returns correctly" do
121     ba = BitArray.new(10)
122     @ba.bit_set(4)
123     @ba.bit_set(5)
124     ba.bit_set(5)
125     ba.bit_set(6)
126     assert_equal("0000010000", (@ba & ba).to_s)
127   end
128
129   test "#| with uneven sizes raises" do
130     ba = BitArray.new(11)
131     assert_raise(BitArrayError) { @ba | ba }
132   end
133
134   test "#| returns correctly" do
135     ba = BitArray.new(10)
136     @ba.bit_set(4)
137     @ba.bit_set(5)
138     ba.bit_set(5)
139     ba.bit_set(6)
140     assert_equal("0000111000", (@ba | ba).to_s)
141   end
142
143   test "#^ with uneven sizes raises" do
144     ba = BitArray.new(11)
145     assert_raise(BitArrayError) { @ba ^ ba }
146   end
147
148   test "#^ returns correctly" do
149     ba = BitArray.new(10)
150     @ba.bit_set(4)
151     @ba.bit_set(5)
152     ba.bit_set(5)
153     ba.bit_set(6)
154     assert_equal("0000101000", (@ba ^ ba).to_s)
155   end
156
157   test "#~ returns correctly" do
158     @ba.bit_set(0)
159     @ba.bit_set(9)
160
161     assert_equal("0111111110", (~@ba).to_s)
162   end
163
164   test "#interval_set with bad interval raises" do
165     assert_raise(BitArrayError) { @ba.interval_set(-1, 4) }
166     assert_raise(BitArrayError) { @ba.interval_set(1, 10) }
167     assert_raise(BitArrayError) { @ba.interval_set(4, 2) }
168   end
169
170   test "#interval_set returns correctly" do
171     @ba.interval_set(0, 0)
172     assert_equal("1000000000", @ba.to_s)
173     @ba.interval_set(9, 9)
174     assert_equal("1000000001", @ba.to_s)
175     @ba.interval_set(2, 7)
176     assert_equal("1011111101", @ba.to_s)
177     @ba.interval_set(1, 8)
178     assert_equal("1111111111", @ba.to_s)
179   end
180
181   test "#interval_unset with bad interval raises" do
182     assert_raise(BitArrayError) { @ba.interval_unset(-1, 4) }
183     assert_raise(BitArrayError) { @ba.interval_unset(1, 10) }
184     assert_raise(BitArrayError) { @ba.interval_unset(4, 2) }
185   end
186
187   test "#interval_unset returns correctly" do
188     ~@ba
189
190     @ba.interval_unset(0, 0)
191     assert_equal("0111111111", @ba.to_s)
192     @ba.interval_unset(9, 9)
193     assert_equal("0111111110", @ba.to_s)
194     @ba.interval_unset(2, 7)
195     assert_equal("0100000010", @ba.to_s)
196     @ba.interval_unset(1, 8)
197     assert_equal("0000000000", @ba.to_s)
198   end
199
200   test "#each_interval returns correctly" do
201     @ba.fill!
202     @ba.bit_unset(4)
203     
204     assert_equal([[0, 3], [5, 9]], @ba.each_interval.to_a)
205   end
206 end
207