bp_test/test/test_write_tab

   1 #!/bin/bash
   2
   3 source "$BP_DIR/bp_test/lib/test.sh"
   4
   5 run "$bp -I $in -o $tmp -x"
   6 assert_no_diff $tmp $out.1
   7 clean
   8
   9 run "$bp -I $in -c -o $tmp -x"
  10 assert_no_diff $tmp $out.2
  11 clean
  12
  13 run "$bp -I $in -d ',' -o $tmp -x"
  14 assert_no_diff $tmp $out.3
  15 clean
  16
  17 run "$bp -I $in -Z gzip -o $tmp.gz -x"
  18 gunzip $tmp.gz
  19 assert_no_diff $tmp $out.4
  20 clean
  21
  22 run "$bp -I $in -Z bzip2 -o $tmp.bz2 -x"
  23 bunzip2 $tmp.bz2
  24 assert_no_diff $tmp $out.4
  25 clean
  26
  27 run "$bp -I $in -k 'Count' -o $tmp -x"
  28 assert_no_diff $tmp $out.5
  29 clean
  30
  31 run "$bp -I $in -K 'Count' -o $tmp -x"
  32 assert_no_diff $tmp $out.6
  33 clean
  34
  35 run "$bp -I $in -p -o $tmp -x"
  36 assert_no_diff $tmp $out.7
  37 clean
  38
  39 run "$bp -I $in -p -C -o $tmp -x"
  40 assert_no_diff $tmp $out.8
  41 clean
  42
  43 run "$bp -I $in -p -c -C -o $tmp -x"
  44 assert_no_diff $tmp $out.9
  45 clean