bp_test/test/test_write_fastq_files

   1 #!/bin/bash
   2
   3 source "$BP_DIR/bp_test/lib/test.sh"
   4
   5 mkdir $tmp_dir
   6
   7 run "$bp -I $in -d $tmp_dir -k SEQ_NAME -x"
   8 assert_no_diff_dir $tmp_dir $out.1
   9 clean
  10
  11 rm -rf $tmp_dir
  12
  13 mkdir $tmp_dir
  14
  15 run "$bp -I $in -e base_33 -d $tmp_dir -k SEQ_NAME -x"
  16 assert_no_diff_dir $tmp_dir $out.1
  17 clean
  18
  19 rm -rf $tmp_dir
  20
  21 mkdir $tmp_dir
  22
  23 run "$bp -I $in -e base_64 -d $tmp_dir -k SEQ_NAME -x"
  24 assert_no_diff_dir $tmp_dir $out.2
  25 clean
  26
  27 rm -rf $tmp_dir