bp_test/test/test_write_fasta

   1 #!/bin/bash
   2
   3 source "$BP_DIR/bp_test/lib/test.sh"
   4
   5 run "$bp -I $in -o $tmp -x"
   6 assert_no_diff $tmp $out.1
   7 clean
   8
   9 run "$bp -I $in -w 4 -o $tmp -x"
  10 assert_no_diff $tmp $out.2
  11 clean
  12
  13 run "$bp -I $in -w 4 -Z gzip -o $tmp.gz -x"
  14 gunzip $tmp.gz
  15 assert_no_diff $tmp $out.3
  16 clean
  17
  18 run "$bp -I $in -w 4 -Z bzip2 -o $tmp.bz2 -x"
  19 bunzip2 $tmp.bz2
  20 assert_no_diff $tmp $out.3
  21 clean