]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blob - bp_test/test/test_usearch_seq
fixing usearch upgrade
[biopieces.git] / bp_test / test / test_usearch_seq
1 #!/bin/bash
2
3 source "$BP_DIR/bp_test/lib/test.sh"
4
5 run "$bp -I $in -d $in.db -i 1 -O $tmp"
6 assert_no_diff $tmp $out.1
7 clean
8
9 run "$bp -I $in -d $in.db -i 1 -p local -O $tmp"
10 assert_no_diff $tmp $out.2
11 clean
12
13 run "$bp -I $in -d $in.db -i 0.99 -e 0.1 -p local -O $tmp"
14 assert_no_diff $tmp $out.3
15 clean
16
17 run "$bp -I $in -d $in.db -i 0.99 -O $tmp"
18 assert_no_diff $tmp $out.4
19 clean
20
21 run "$bp -I $in -d $in.db -i 1 -m 1 -O $tmp"
22 assert_no_diff $tmp $out.5
23 clean