bp_test/test/test_get_seq

   1 #!/bin/bash
   2
   3 source "$BP_DIR/bp_test/lib/test.sh"
   4
   5 run_quiet "create_seq_index -I $in.1 -d $tmp_dir -i test -x"
   6
   7 run "$bp -i $tmp_dir/test -s test1 -b 10 -O $tmp"
   8 assert_no_diff $tmp $out.1
   9 clean
  10
  11 run "$bp -i $tmp_dir/test -s test1 -e 10 -O $tmp"
  12 assert_no_diff $tmp $out.2
  13 clean
  14
  15 run "$bp -i $tmp_dir/test -s test1 -l 10 -O $tmp"
  16 assert_no_diff $tmp $out.3
  17 clean
  18
  19 run "$bp -i $tmp_dir/test -s test1 -b 10 -l 10 -O $tmp"
  20 assert_no_diff $tmp $out.4
  21 clean
  22
  23 run "$bp -I $in.2 -i $tmp_dir/test -O $tmp"
  24 assert_no_diff $tmp $out.5
  25 clean
  26
  27 rm -rf $tmp_dir