bp_test/out/find_homopolymers.out.2

   1 SEQ_NAME: test1
   2 SEQ: attcccggggnnnnn
   3 SEQ_LEN: 15
   4 HOMOPOL_PAT: CCC
   5 HOMOPOL_LEN: 3
   6 HOMOPOL_POS: 3
   7 ---
   8 SEQ_NAME: test1
   9 SEQ: attcccggggnnnnn
  10 SEQ_LEN: 15
  11 HOMOPOL_PAT: GGGG
  12 HOMOPOL_LEN: 4
  13 HOMOPOL_POS: 6
  14 ---
  15 SEQ_NAME: test1
  16 SEQ: attcccggggnnnnn
  17 SEQ_LEN: 15
  18 HOMOPOL_PAT: NNNNN
  19 HOMOPOL_LEN: 5
  20 HOMOPOL_POS: 10
  21 ---
  22 SEQ_NAME: test2
  23 SEQ: nnnnnggggccctta
  24 SEQ_LEN: 15
  25 HOMOPOL_PAT: NNNNN
  26 HOMOPOL_LEN: 5
  27 HOMOPOL_POS: 0
  28 ---
  29 SEQ_NAME: test2
  30 SEQ: nnnnnggggccctta
  31 SEQ_LEN: 15
  32 HOMOPOL_PAT: GGGG
  33 HOMOPOL_LEN: 4
  34 HOMOPOL_POS: 5
  35 ---
  36 SEQ_NAME: test2
  37 SEQ: nnnnnggggccctta
  38 SEQ_LEN: 15
  39 HOMOPOL_PAT: CCC
  40 HOMOPOL_LEN: 3
  41 HOMOPOL_POS: 9
  42 ---
  43 SEQ_NAME: test3
  44 SEQ: a
  45 SEQ_LEN: 1
  46 ---
  47 SEQ_NAME: test4
  48 SEQ: aA
  49 SEQ_LEN: 2
  50 ---