]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blob - bp_scripts/stats_biopieces.sh
fixed encoding bug in read_454
[biopieces.git] / bp_scripts / stats_biopieces.sh
1 #!/bin/sh
2
3 # Count how many times each Biopieces has been used and output as a table.
4
5 read_tab -d '\t' -i $BP_LOG/biopieces.log -k TIME_BEG,TIME_END,TIME_ELAP,USER,STATUS,COMMAND |
6 split_vals -d ' ' -k COMMAND |
7 count_vals -k COMMAND_0 |
8 uniq_vals -k COMMAND_0 |
9 sort_records -k COMMAND_0_COUNTn -r |
10 write_tab -k COMMAND_0_COUNT,COMMAND_0 -x