]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blob - bp_bin/list_mysql_databases
fixed seq qual length check
[biopieces.git] / bp_bin / list_mysql_databases
1 #!/usr/bin/env perl
2
3 # Copyright (C) 2007-2009 Martin A. Hansen.
4
5 # This program is free software; you can redistribute it and/or
6 # modify it under the terms of the GNU General Public License
7 # as published by the Free Software Foundation; either version 2
8 # of the License, or (at your option) any later version.
9
10 # This program is distributed in the hope that it will be useful,
11 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
13 # GNU General Public License for more details.
14
15 # You should have received a copy of the GNU General Public License
16 # along with this program; if not, write to the Free Software
17 # Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18
19 # http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html
20
21
22 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> DESCRIPTION <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
23
24 # Display all MySQL databases.
25
26 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
27
28
29 use warnings;
30 use strict;
31 use Maasha::Common;
32 use Maasha::Biopieces;
33 use Maasha::SQL;
34
35
36 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
37
38
39 my ( $options, $user, $password, @databases, $database );
40
41 $user     = Maasha::Biopieces::biopiecesrc( "MYSQL_USER" );
42 $password = Maasha::Biopieces::biopiecesrc( "MYSQL_PASSWORD" );
43
44 $options = Maasha::Biopieces::parse_options(
45     [
46         { long => 'user',     short => 'u', type => 'string', mandatory => 'no', default => $user,     allowed => undef, disallowed => undef },
47         { long => 'password', short => 'p', type => 'string', mandatory => 'no', default => $password, allowed => undef, disallowed => undef },
48     ]   
49 );
50
51 @databases = Maasha::SQL::list_databases( $options->{ 'user' }, $options->{ 'password' } );
52
53 map { Maasha::Biopieces::put_record( { 'DATABASE' => $_ } ) } @databases;
54
55
56 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
57
58
59 BEGIN
60 {
61     Maasha::Biopieces::status_set();
62 }
63
64
65 END
66 {
67     Maasha::Biopieces::status_log();
68 }
69
70
71 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
72
73
74 __END__