bp_bin/list_biopieces

   1 #!/usr/bin/env perl -w
   2
   3 # Copyright (C) 2007-2009 Martin A. Hansen.
   4
   5 # This program is free software; you can redistribute it and/or
   6 # modify it under the terms of the GNU General Public License
   7 # as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8 # of the License, or (at your option) any later version.
   9
  10 # This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13 # GNU General Public License for more details.
  14
  15 # You should have received a copy of the GNU General Public License
  16 # along with this program; if not, write to the Free Software
  17 # Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
  18
  19 # http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html
  20
  21
  22 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> DESCRIPTION <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  23
  24 # Print summary for all Biopices.
  25
  26 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  27
  28
  29 use strict;
  30 use Maasha::Common;
  31 use Maasha::Biopieces;
  32 use Maasha::Gwiki;
  33
  34
  35 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  36
  37
  38 my ( $options, @files, $file, $wiki, $program, $summary );
  39
  40 $options = Maasha::Biopieces::parse_options();
  41
  42 @files = Maasha::Filesys::ls_files( "$ENV{ 'BP_DIR' }/bp_usage" );
  43
  44 foreach $file ( sort @files )
  45 {
  46     if ( $file =~ /\/([a-z0-9_]+)\.wiki$/ )
  47     {
  48         $program = $1;
  49
  50         $wiki = Maasha::Gwiki::gwiki_read( $file );
  51
  52         $summary = $wiki->[ 0 ]->[ 0 ]->{ 'TEXT' };
  53         $summary =~ s/^#summary\s+//;
  54
  55         printf( "%-30s%s\n", $program, $summary );
  56     }
  57 }
  58
  59
  60 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  61
  62
  63 BEGIN
  64 {
  65     $run_time_beg = Maasha::Biopieces::run_time();
  66
  67     Maasha::Biopieces::log_biopiece();
  68 }
  69
  70 END
  71 {
  72     $run_time_end = Maasha::Biopieces::run_time();
  73
  74     Maasha::Biopieces::run_time_print( $run_time_beg, $run_time_end, $options );
  75 }
  76
  77
  78 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  79
  80
  81 __END__
  82
  83