bp_bin/list_biopieces

   1 #!/usr/bin/env perl
   2
   3 # Copyright (C) 2007-2009 Martin A. Hansen.
   4
   5 # This program is free software; you can redistribute it and/or
   6 # modify it under the terms of the GNU General Public License
   7 # as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8 # of the License, or (at your option) any later version.
   9
  10 # This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13 # GNU General Public License for more details.
  14
  15 # You should have received a copy of the GNU General Public License
  16 # along with this program; if not, write to the Free Software
  17 # Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
  18
  19 # http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html
  20
  21
  22 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> DESCRIPTION <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  23
  24 # Print summary for all Biopices.
  25
  26 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  27
  28
  29 use warnings;
  30 use strict;
  31 use Maasha::Common;
  32 use Maasha::Biopieces;
  33 use Maasha::Gwiki;
  34
  35
  36 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  37
  38
  39 my ( $options, @files, $file, $wiki, $program, $summary );
  40
  41 $options = Maasha::Biopieces::parse_options();
  42
  43 @files = Maasha::Filesys::ls_files( "$ENV{ 'BP_DIR' }/bp_usage" );
  44
  45 foreach $file ( sort @files )
  46 {
  47     if ( $file =~ /\/([BGa-z0-9_]+)\.wiki$/ )
  48     {
  49         $program = $1;
  50
  51         $wiki = Maasha::Gwiki::gwiki_read( $file );
  52
  53         $summary = $wiki->[ 0 ]->[ 0 ]->{ 'TEXT' };
  54         $summary =~ s/^#summary\s+//;
  55
  56         printf( "%-30s%s\n", $program, $summary );
  57     }
  58 }
  59
  60
  61 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  62
  63
  64 BEGIN
  65 {
  66     Maasha::Biopieces::status_set();
  67 }
  68
  69
  70 END
  71 {
  72     Maasha::Biopieces::status_log();
  73 }
  74
  75
  76 # >>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
  77
  78
  79 __END__