]> git.donarmstrong.com Git - bamtools.git/commitdiff
Updated MergeOrder enum documentation
authorDerek Barnett <derekwbarnett@gmail.com>
Tue, 15 Jan 2013 01:41:23 +0000 (20:41 -0500)
committerDerek Barnett <derekwbarnett@gmail.com>
Tue, 15 Jan 2013 01:41:23 +0000 (20:41 -0500)
src/api/BamMultiReader.cpp

index 57c826daa80ccd5368bc0cde3c7254d1f417f496..9e8920acdc5c4f683f045b52bbbdc481497e0b57 100644 (file)
@@ -23,19 +23,22 @@ using namespace std;
 /*! \class BamTools::BamMultiReader
     \brief Convenience class for reading multiple BAM files.
 */
-
 /*! \enum BamMultiReader::MergeOrder
-    \brief A description of the enum type.
+    \brief Used to describe the merge strategy of the BamMultiReader.
+
+    The merge strategy determines which alignment is 'next' from across
+    all opened BAM files.
+*/
+/*! \var BamMultiReader::MergeOrder BamMultiReader::RoundRobinMerge
+    \brief Merge strategy when BAM files are unsorted, or their sorted status is either unknown or ignored
 */
 /*! \var BamMultiReader::MergeOrder BamMultiReader::MergeByCoordinate
-    \brief The description of the first enum value.
+    \brief Merge strategy when BAM files are sorted by position ('coordinate')
 */
 /*! \var BamMultiReader::MergeOrder BamMultiReader::MergeByName
-    \brief BAM files are
+    \brief Merge strategy when BAM files are sorted by read name ('queryname')
 */
 
-
-
 /*! \fn BamMultiReader::BamMultiReader(void)
     \brief constructor
 */