src/test/api/BamRegionTest.h

   1 #ifndef BAMAUX_BAMREGIONTEST_H
   2 #define BAMAUX_BAMREGIONTEST_H
   3
   4 #include "api/BamAux.h"
   5 #include <gtest/gtest.h>
   6
   7 TEST(BamAux_BamRegionTest, DefaultValues) {
   8     BamTools::BamRegion region;
   9     EXPECT_EQ(-1, region.LeftRefID);
  10     EXPECT_EQ(-1, region.LeftPosition);
  11     EXPECT_EQ(-1, region.RightRefID);
  12     EXPECT_EQ(-1, region.RightPosition);
  13 }
  14
  15 TEST(BamAux_BamRegionTest, IsNull) {
  16
  17     BamTools::BamRegion empty;
  18     EXPECT_TRUE(empty.isNull());
  19
  20     BamTools::BamRegion normal(1,100,2,200);
  21     EXPECT_FALSE(normal.isNull());
  22 }
  23
  24 TEST(BamAux_BamRegionTest, Clear) {
  25
  26     BamTools::BamRegion region(1,100);
  27     EXPECT_FALSE(region.isNull());
  28     region.clear();
  29     EXPECT_TRUE(region.isNull());
  30 }
  31
  32 TEST(BamAux_BamRegionTest, IsLeftBoundSpecified) {
  33
  34     // no left bound
  35     BamTools::BamRegion empty;
  36     EXPECT_FALSE(empty.isLeftBoundSpecified());
  37
  38     // regular left bound
  39     BamTools::BamRegion region(1, 100);
  40     EXPECT_TRUE(region.isLeftBoundSpecified());
  41
  42     // invalid left bound
  43     BamTools::BamRegion invalidID(-2);
  44     EXPECT_FALSE(invalidID.isLeftBoundSpecified());
  45     BamTools::BamRegion invalidPosition(1, -200);
  46     EXPECT_FALSE(invalidPosition.isLeftBoundSpecified());
  47 }
  48
  49 #endif // BAMAUX_BAMREGIONTEST_H