Makefile

   1 CXX=            g++\r
   2 CXXFLAGS=       -Wall -O3\r
   3 PROG=           BamConversion BamDump BamTrim bamtools\r
   4 LIBS=           -lz\r
   5 \r
   6 all: $(PROG)\r
   7 \r
   8 bamtools: BGZF.o BamReader.o BamWriter.o BamMultiReader.o bamtools.o\r
   9         $(CXX) $(CXXFLAGS) -o $@ BGZF.o BamReader.o BamWriter.o BamMultiReader.o bamtools.o $(LIBS)\r
  10 \r
  11 BamConversion:  BGZF.o BamReader.o BamWriter.o BamConversionMain.o\r
  12         $(CXX) $(CXXFLAGS) -o $@  BGZF.o BamReader.o BamWriter.o BamConversionMain.o $(LIBS)\r
  13 \r
  14 BamDump:  BGZF.o BamReader.o BamDumpMain.o\r
  15         $(CXX) $(CXXFLAGS) -o $@  BGZF.o BamReader.o BamDumpMain.o $(LIBS)\r
  16 \r
  17 BamTrim:  BGZF.o BamReader.o BamWriter.o BamTrimMain.o\r
  18         $(CXX) $(CXXFLAGS) -o $@  BGZF.o BamReader.o BamWriter.o BamTrimMain.o $(LIBS)\r
  19 \r
  20 clean:\r
  21         rm -fr gmon.out *.o *.a a.out *~ $(PROG)\r